RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 CAPN15O75808 1086 aa35.99■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP35.99■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 MTX1Q13505 466 aa35.98■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP35.98■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa35.97■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR66Q8TBY9 1149 aa35.97■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 TEKT1Q969V4 418 aa35.97■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFAIP1Q13829 316 aa35.96■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 RASA3Q14644 834 aa35.96■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 SPDYE2Q495Y8 402 aa35.96■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 MAST3O60307 1309 aa35.95■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 ITPRIPQ8IWB1 547 aa35.95■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 FZD1Q9UP38 647 aa35.95■■■■□ 3.35
SEMA3B-215ENST00000621029 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP35.94■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa35.94■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TCP10L2B9ZVM9 353 aa35.93■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TFCP2Q12800 502 aa35.93■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 CSRNP1Q96S65 589 aa35.93■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 AKAP2Q9Y2D5 859 aa35.93■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ADORA1P30542 326 aa35.92■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP35.92■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ARAP2Q8WZ64 1704 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 PHKA1P46020 1223 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TNNI2P48788 182 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TIMM10P62072 90 aa35.91■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP35.9■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP35.9■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TRPA1O75762 1119 aa35.89■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 NEUROD6Q96NK8 337 aa35.89■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 TMOD2Q9NZR1 351 aa35.89■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 DENND2AQ9ULE3 1009 aa35.89■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 ECM29Q5VYK3 1845 aa35.89■■■■□ 3.34
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A1B0GUL7 405 aa35.88■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 LDLRAD1Q5T700 205 aa35.88■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC102BQ68D86 513 aa35.88■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 ZDHHC15Q96MV8 337 aa35.88■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 MRIQ9BWK5 157 aa35.88■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 RNF186Q9NXI6 227 aa35.88■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 SEMA3EO15041 775 aa35.87■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 RLBP1P12271 317 aa35.87■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC10A4Q96EP9 437 aa35.87■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 C1orf115Q9H7X2 142 aa35.87■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 CACNB3P54284 484 aa35.86■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 SAGE1Q9NXZ1 904 aa35.86■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 LDHBP07195 334 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 IREB2P48200 963 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 GORABQ5T7V8 394 aa35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 HHIPL2Q6UWX4 724 aa35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 XAGE2Q96GT9 111 aa35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 TMEM39BQ9GZU3 492 aa35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 SSC5DA1L4H1 1573 aa35.85■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 MVPQ14764 893 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 PRDX5P30044 214 aa35.83■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 MAP3K11Q16584 847 aa35.83■■■■□ 3.33
SEMA3B-215ENST00000621029 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP35.82■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 USP2O75604 605 aaPredicted RBP35.81■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP8B2P98198 1209 aa35.81■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 DIXDC1Q155Q3 683 aa35.81■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 PANK1Q8TE04 598 aa35.81■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 CLMNQ96JQ2 1002 aa35.81■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 RASGRF1Q13972 1273 aa35.8■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 SPRYD7Q5W111 196 aa35.8■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 CDAN1Q8IWY9 1227 aa35.8■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 MYH13Q9UKX3 1938 aa35.79■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 SREBF2Q12772 1141 aa35.79■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 TEPSINQ96N21 525 aa35.79■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 ABCF2Q9UG63 623 aa35.79■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 SALL1Q9NSC2 1324 aa35.79■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 POLA2Q14181 598 aa35.78■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa35.78■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 SURF6O75683 361 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 MS4A1P11836 297 aa35.77■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa35.77■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 SSH3Q8TE77 659 aa35.77■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 UNCXA6NJT0 531 aa35.76■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
SEMA3B-215ENST00000621029 FKBP1CQ5VVH2 108 aa35.75■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 TM4SF4P48230 202 aa35.74■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP35.74■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 FAM83AQ86UY5 434 aa35.74■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 WNK4Q96J92 1243 aa35.74■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 AKAP11Q9UKA4 1901 aa35.73■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa35.72■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 HOOK2Q96ED9 719 aa35.72■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 ELP3Q9H9T3 547 aa35.72■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 USP40Q9NVE5 1235 aa35.72■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP35.71■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB22O15209 634 aa35.71■■■■□ 3.31
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D8O95759 1140 aa35.71■■■■□ 3.31
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