RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 F8W031 263 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 CREBZFQ9NS37 354 aa26.02■■□□□ 1.76
SGMS1-210ENST00000619438 TRAF5O00463 557 aa26.01■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 REC8O95072 547 aa26.01■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.01■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26■■□□□ 1.752e-16■■■■■ 102.3
SGMS1-210ENST00000619438 TFCP2Q12800 502 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 USP48Q86UV5 1035 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 CERS5Q8N5B7 392 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 MFSD14BQ5SR56 506 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 KRT26Q7Z3Y9 468 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 ERC2O15083 957 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 DDIT3P35638 169 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 TIMM10P62072 90 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 GGA3Q9NZ52 723 aa25.99■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 RABEP1Q15276 862 aa25.98■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 SULF1Q8IWU6 871 aa25.98■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 NBPF9Q3BBW0 867 aa25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 NEUROD6Q96NK8 337 aa25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 ZNF408Q9H9D4 720 aa25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 DLGAP5Q15398 846 aa25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 WNT10BO00744 389 aa25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 BCL11AQ9H165 835 aa25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SGMS1-210ENST00000619438 A0A1B0GUL7 405 aa25.95■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 GORABQ5T7V8 394 aa25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 ADM5C9JUS6 153 aa25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 ADORA1P30542 326 aa25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 CST9Q5W186 159 aa25.93■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 CFAP100Q494V2 611 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 DLK2Q6UY11 383 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 XAGE2Q96GT9 111 aa25.92■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 MYO1BO43795 1136 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 PHKA1P46020 1223 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC102BQ68D86 513 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 WDR66Q8TBY9 1149 aa25.91■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 JMYQ8N9B5 988 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 CHMLP26374 656 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.9■■□□□ 1.74
SGMS1-210ENST00000619438 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 GSE1Q14687 1217 aa25.89■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 DEFB115Q30KQ5 88 aa25.89■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 MTMR14Q8NCE2 650 aa25.89■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 CNTNAP1P78357 1384 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SEMA3EO15041 775 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.88■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 GRIK5Q16478 980 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 IL17RAQ96F46 866 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa25.87■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYE2BA6NHP3 402 aa25.86■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 SPDYE6P0CI01 402 aa25.86■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 CDCA5Q96FF9 252 aa25.86■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 GPR108Q9NPR9 543 aa25.86■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 CRKP46108 304 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 TNNI3KQ59H18 835 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 C2orf69Q8N8R5 385 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 IL27Q8NEV9 243 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa25.85■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 CLRN2A0PK11 232 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 TEKT1Q969V4 418 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 VEZTQ9HBM0 779 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 TLL2Q9Y6L7 1015 aa25.84■■□□□ 1.73
SGMS1-210ENST00000619438 RASSF10A6NK89 507 aa25.83■■□□□ 1.73
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