RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592857.5

SLC25A39-216, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

TSL 3

Gene SLC25A39, Length 837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-216ENST00000592857 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 MAP3K11Q16584 847 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 TRPA1O75762 1119 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 GNAI3P08754 354 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 RASA3Q14644 834 aa26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 IL15P40933 162 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 MTX1Q13505 466 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 ATP2B3Q16720 1220 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 ABHD8Q96I13 439 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.27■■□□□ 1.8
SLC25A39-216ENST00000592857 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 MYH13Q9UKX3 1938 aa26.25■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 TNFAIP1Q13829 316 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 TEPSINQ96N21 525 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 MRIQ9BWK5 157 aa26.24■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 TEKT1Q969V4 418 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.23■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 SRGAP3O43295 1099 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 TM4SF4P48230 202 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 SPRYD7Q5W111 196 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.22■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 TCP10L2B9ZVM9 353 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 USP2O75604 605 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 MCOLN1Q9GZU1 580 aa26.21■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 MAST3O60307 1309 aa26.2■■□□□ 1.79
SLC25A39-216ENST00000592857 UNCXA6NJT0 531 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 ADORA1P30542 326 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 PHKA1P46020 1223 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 OTOFQ9HC10 1997 aa26.2■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB22O15209 634 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 GNAI2P04899 355 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 CACNB3P54284 484 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.19■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 LAMB1P07942 1786 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 IREB2P48200 963 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 SLC10A4Q96EP9 437 aa26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 SEMA3EO15041 775 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TNNI2P48788 182 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 SREBF2Q12772 1141 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 DGKZQ13574 1117 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 WNK4Q96J92 1243 aa26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 SALL1Q9NSC2 1324 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 PRDX5P30044 214 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TIMM10P62072 90 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TFCP2Q12800 502 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 CCDC102BQ68D86 513 aa26.16■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 TBC1D8O95759 1140 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.15■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 A0A1B0GUL7 405 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 GJA5P36382 358 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 DIXDC1Q155Q3 683 aa26.14■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
SLC25A39-216ENST00000592857 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 RASGRF1Q13972 1273 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 FAM83AQ86UY5 434 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.13■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 RLBP1P12271 317 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 XAGE2Q96GT9 111 aa26.12■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 LDHBP07195 334 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.771e-6■□□□□ 9.4
SLC25A39-216ENST00000592857 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 AKAP2Q9Y2D5 859 aa26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 POLA2Q14181 598 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 ELP3Q9H9T3 547 aa26.1■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.09■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 INHBEP58166 350 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 VGLL4Q14135 290 aa26.09■■□□□ 1.77
SLC25A39-216ENST00000592857 IFNL1Q8IU54 200 aa26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms