RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SV2B	Q7L1I2	683 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	NAGPA	Q9UK23	515 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SLC6A14	Q9UN76	642 aa		7.33	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A096LPE4	126 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608		A0A1W2PPZ6	126 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PROC	P04070	461 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TFE3	P19532	575 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CRK	P46108	304 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC81	Q6ZN84	652 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TLDC2	A0PJX2	215 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD62	A6NC57	917 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608		M0R082	166 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO27	Q8NI29	283 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	NXPE3	Q969Y0	559 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF576	Q9H609	170 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TBX22	Q9Y458	520 aa		7.31	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ITPKA	P23677	461 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PCSK7	Q16549	785 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	RASIP1	Q5U651	963 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		7.3	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	GREM1	O60565	184 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ALAS2	P22557	587 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SOX9	P48436	509 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SIK1	P57059	783 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SOGA3	Q5TF21	947 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SDE2	Q6IQ49	451 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM102	Q8N9M5	508 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CEP44	Q9C0F1	390 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PPT2	Q9UMR5	302 aa		7.29	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	RLBP1	P12271	317 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	NID1	P14543	1247 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	LMNB2	Q03252	620 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SERINC3	Q13530	473 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SEZ6	Q53EL9	994 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PERM1	Q5SV97	790 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF746	Q6NUN9	644 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	SPOCK3	Q9BQ16	436 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PLVAP	Q9BX97	442 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	PBX4	Q9BYU1	374 aa		7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	MRPL42	Q9Y6G3	142 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	PIK3R2	O00459	728 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	F13A1	P00488	732 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	CHRNA4	P43681	627 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	SEPT6	Q14141	434 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM35A	Q86V20	835 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NKD1	Q969G9	470 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		7.27	□□□□□ -1.25
ATP9B-223	ENST00000590608	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms