RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 RGS3P49796 1198 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC57Q2TAC2 916 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC152Q4G0S7 254 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TSHZ3Q63HK5 1081 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ATG9AQ7Z3C6 839 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SMC5Q8IY18 1101 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 CYP4X1Q8N118 509 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
CAPNS1-208ENST00000589162 EYA2O00167 538 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NLGN2Q8NFZ4 835 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 COPRSQ9NQ92 184 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CNNM1Q9NRU3 951 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PKD2L1Q9P0L9 805 aa7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SLX4Q8IY92 1834 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF13BQ9NQT8 1826 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SRGNP10124 158 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRK1P26718 216 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 POLD1P28340 1107 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ADORA1P30542 326 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NUCB1Q02818 461 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 AAMPQ13685 434 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CRY2Q49AN0 593 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL24Q5JXM2 366 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 KIFC2Q96AC6 838 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 HDAC5Q9UQL6 1122 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 RTL9Q8NET4 1388 aa7.45□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNA3P22001 575 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PDE6BP35913 854 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM10P62072 90 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS8P62241 208 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GPSM2P81274 684 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CHRNDQ07001 517 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 FOXC1Q12948 553 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GRAPQ13588 217 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 AACSQ86V21 672 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 SPON1Q9HCB6 807 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF609O15014 1411 aa7.44□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 H0YIN7 160 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NPR1P16066 1061 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TNNI3KQ59H18 835 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 GCC1Q96CN9 775 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 NEUROD6Q96NK8 337 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 MPHOSPH8Q99549 860 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 MINPP1Q9UNW1 487 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC37AA6NMS7 1700 aa7.43□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 C21orf2O43822 256 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB11FIP3O75154 756 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CIAO1O76071 339 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJB2P25686 324 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 IL15P40933 162 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP2B3Q16720 1220 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 MASTLQ96GX5 879 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CRAMP1Q96RY5 1269 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DACH1Q9UI36 760 aa7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
CAPNS1-208ENST00000589162 DUOX1Q9NRD9 1551 aa7.42□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms