RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587752.5

CTIF-203, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 5

Gene CTIF, Length 683 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-203ENST00000587752 CSRNP1Q96S65 589 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 FBXO3Q9UK99 471 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.72■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 TRPA1O75762 1119 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 IL15P40933 162 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 RASA3Q14644 834 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 SPDYE2Q495Y8 402 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 TMEM57Q8N5G2 664 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 COPRSQ9NQ92 184 aa18.71■□□□□ 0.59
CTIF-203ENST00000587752 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 SSC5DA1L4H1 1573 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TCP10L2B9ZVM9 353 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 RNF186Q9NXI6 227 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa18.7■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 GNAI2P04899 355 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 ADORA1P30542 326 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TEKT1Q969V4 418 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.69■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 PHKA1P46020 1223 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 CACNB3P54284 484 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 LDLRAD1Q5T700 205 aa18.68■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TIMM10P62072 90 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TFCP2Q12800 502 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 MTX1Q13505 466 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TNFAIP1Q13829 316 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 CDAN1Q8IWY9 1227 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 WDR66Q8TBY9 1149 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 CLMNQ96JQ2 1002 aa18.67■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TMEM39BQ9GZU3 492 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 SAGE1Q9NXZ1 904 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 MAST3O60307 1309 aa18.66■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 RLBP1P12271 317 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 ZDHHC15Q96MV8 337 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa18.65■□□□□ 0.58
CTIF-203ENST00000587752 A0A1B0GUL7 405 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 USP2O75604 605 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 PRDX5P30044 214 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 IREB2P48200 963 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 TNNI2P48788 182 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 MAP3K11Q16584 847 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 SPRYD7Q5W111 196 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 CCDC102BQ68D86 513 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ABHD8Q96I13 439 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 TEPSINQ96N21 525 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 TMOD2Q9NZR1 351 aa18.64■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 NEUROD6Q96NK8 337 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.63■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 TBC1D8O95759 1140 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 LDHBP07195 334 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 DGKZQ13574 1117 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 HHIPL2Q6UWX4 724 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 XAGE2Q96GT9 111 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 MRIQ9BWK5 157 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.62■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 SEMA3EO15041 775 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 TM4SF4P48230 202 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 RASGRF1Q13972 1273 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 WNK4Q96J92 1243 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 MCOLN1Q9GZU1 580 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa18.61■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 SREBF2Q12772 1141 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ELP3Q9H9T3 547 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 OTOFQ9HC10 1997 aa18.6■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 GJA5P36382 358 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ATP8B2P98198 1209 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 POLA2Q14181 598 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 MVPQ14764 893 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 GORABQ5T7V8 394 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 PANK1Q8TE04 598 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ABCF2Q9UG63 623 aa18.59■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 SALL1Q9NSC2 1324 aa18.58■□□□□ 0.57
CTIF-203ENST00000587752 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 TCP10Q12799 353 aa18.58■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa18.58■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 MYH2Q9UKX2 1941 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 CCDC85CA6NKD9 419 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 PI16Q6UXB8 463 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 FAM83AQ86UY5 434 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa18.57■□□□□ 0.56
CTIF-203ENST00000587752 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms