RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582955.5

SMARCE1-218, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 621 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-218ENST00000582955 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 ERC1Q8IUD2 1116 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 GPR108Q9NPR9 543 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa15.52■□□□□ 0.08
SMARCE1-218ENST00000582955 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa15.52■□□□□ 0.08
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SMARCE1-218ENST00000582955 DEFB115Q30KQ5 88 aa15.51■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa15.51■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 APBB1O00213 710 aa15.5■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa15.5■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SIRT2Q8IXJ6 389 aa15.5■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 C2orf69Q8N8R5 385 aa15.5■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.49■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SAPCD2Q86UD0 394 aa15.49■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 ABCF2Q9UG63 623 aa15.49■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 BCL11AQ9H165 835 aa15.48■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 DIXDC1Q155Q3 683 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CYP4F22Q6NT55 531 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PI16Q6UXB8 463 aa15.47■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 SPATA5Q8NB90 893 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 KIF1BPQ96EK5 621 aa15.47■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 DEFB129Q9H1M3 183 aa15.47■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa15.47■□□□□ 0.07
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SMARCE1-218ENST00000582955 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CAPNS2Q96L46 248 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 CRBNQ96SW2 442 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 MRIQ9BWK5 157 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa15.46■□□□□ 0.07
SMARCE1-218ENST00000582955 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RAB11FIP3O75154 756 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TNFAIP1Q13829 316 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RASA3Q14644 834 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ERICH6Q7L0X2 663 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SNRKQ9NRH2 765 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.45■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TNNI2P48788 182 aa15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 CACNB3P54284 484 aa15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 FKBP1BP68106 108 aa15.44■□□□□ 0.06
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SMARCE1-218ENST00000582955 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 MOB2Q70IA6 237 aa15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa15.44■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RGMBQ6NW40 437 aa15.43■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SLF2Q8IX21 1173 aa15.43■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 RAI14Q9P0K7 980 aa15.43■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 LRP2BPQ9P2M1 347 aa15.43■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 UBE2Q2LH0YL09 131 aa15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 MECOMQ03112 1051 aa15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 ARMC9Q7Z3E5 817 aa15.42■□□□□ 0.06
SMARCE1-218ENST00000582955 AOC2O75106 756 aa15.41■□□□□ 0.06
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