RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-211	ENST00000582232	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.93	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MAST3	O60307	1309 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	HIP1	O00291	1037 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ADD2	P35612	726 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MECOM	Q03112	1051 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	GRIK5	Q16478	980 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.92	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	PDE6A	P16499	860 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	GSTO1	P78417	241 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	SLF2	Q8IX21	1173 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	RAI14	Q9P0K7	980 aa		13.91	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	LDHC	P07864	332 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	CHML	P26374	656 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
GGA3-211	ENST00000582232	GAK	O14976	1311 aa		13.9	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CDC45	O75419	566 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	APPBP2	Q92624	585 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.89	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	GLTPD2	A6NH11	291 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CYP7A1	P22680	504 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.88	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	WDR90	Q96KV7	1748 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232		F8W031	263 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CHGB	P05060	677 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CRK	P46108	304 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SCNN1D	P51172	638 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	PPP4C	P60510	307 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CASC1	Q6TDU7	716 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CERS3	Q8IU89	383 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	OSBP2	Q969R2	916 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SCN4A	P35499	1836 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	RAD50	Q92878	1312 aa		13.87	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232		A0A0D9SFI3	127 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	FAM227B	Q96M60	508 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232		H7C1D1	291 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SGSM2	O43147	1006 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	BAG3	O95817	575 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SPDYE2B	A6NHP3	402 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SPDYE6	P0CI01	402 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	PLCG2	P16885	1265 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	MFAP1	P55081	439 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	C8orf34	Q49A92	452 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-211	ENST00000582232	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		13.84	□□□□□ -0.19

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