RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 SLC51AQ86UW1 340 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 EXOC6Q8TAG9 804 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 VTI1AQ96AJ9 217 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 BACH2Q9BYV9 841 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 ABCC2Q92887 1545 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PIK3C2GO75747 1445 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PLA2R1Q13018 1463 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 MMP20O60882 483 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SSTR4P31391 388 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZS46 218 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 TREML1Q86YW5 311 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 TESK2Q96S53 571 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 KNSTRNQ9Y448 316 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SHROOM2Q13796 1616 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 TRPM2O94759 1503 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PSAPP07602 524 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 AAMPQ13685 434 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PANK3Q9H999 370 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-212ENST00000580838 KANK1Q14678 1352 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 DISP3Q9P2K9 1392 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 TTC37Q6PGP7 1564 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 PLCH2O75038 1416 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 GHRHP01286 108 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 CD97P48960 835 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-212ENST00000580838 WDR7Q9Y4E6 1490 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 ABCC1P33527 1531 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-212ENST00000580838 SOX18P35713 384 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 COX20Q5RI15 118 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 PTPRTO14522 1441 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CEP152O94986 1710 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 MED26O95402 600 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 GLB1P16278 677 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 RGL3Q3MIN7 710 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PTPRM-212ENST00000580838 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 BTBD11A6QL63 1104 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 FAM200AQ8TCP9 573 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CRBNQ96SW2 442 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 RBSNQ9H1K0 784 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 DEPDC5O75140 1603 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ZMYM3Q14202 1370 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 MYOM2P54296 1465 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 E9PSI1 815 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 IGLV1-40P01703 118 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 NEFMP07197 916 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 PPP2R1AP30153 589 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRM-212ENST00000580838 PPME1Q9Y570 386 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRM-212ENST00000580838 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRM-212ENST00000580838 FAM26DQ5JW98 314 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 SAP130Q9H0E3 1048 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 MUC3BQ9H195 1237 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 CGNL1Q0VF96 1302 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ZNF521Q96K83 1311 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 LINC01387J3KSC0 135 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 GSC2O15499 205 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRM-212ENST00000580838 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
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