RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580691.5

CYB561-211, Transcript of cytochrome b561, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CYB561, Length 1,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561-211ENST00000580691 CRKP46108 304 aa28.26■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 HUNKP57058 714 aa28.26■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa28.26■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 PCNTO95613 3336 aa28.26■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 PHKA1P46020 1223 aa28.25■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 CAPNS2Q96L46 248 aa28.25■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.24■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 ADORA1P30542 326 aa28.23■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 MAP2K2P36507 400 aa28.23■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.23■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 DEFB129Q9H1M3 183 aa28.23■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa28.22■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 TNNI2P48788 182 aa28.22■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.22■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 CCDC102AQ96A19 550 aa28.22■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.21■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 SLF2Q8IX21 1173 aa28.21■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 VEZTQ9HBM0 779 aa28.21■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.21■■■□□ 2.11
CYB561-211ENST00000580691 NOGQ13253 232 aa28.2■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 CCDC158Q5M9N0 1113 aa28.2■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 CYP4F22Q6NT55 531 aa28.2■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 RGMBQ6NW40 437 aa28.2■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.2■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 CLRN2A0PK11 232 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 RASGRF1Q13972 1273 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 TNNI3KQ59H18 835 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 DLK2Q6UY11 383 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 AIDAQ96BJ3 306 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 ECM29Q5VYK3 1845 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa28.19■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 IGSF3O75054 1194 aa28.18■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.18■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 ARMC9Q7Z3E5 817 aa28.18■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 GRIK5Q16478 980 aa28.17■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.17■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 UNCXA6NJT0 531 aa28.16■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa28.16■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 GRM1Q13255 1194 aa28.15■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 RASA3Q14644 834 aa28.15■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 SPATA5Q8NB90 893 aa28.15■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 PRDX5P30044 214 aa28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 TTC39AQ5SRH9 613 aa28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 HOOK2Q96ED9 719 aa28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 WBP1LQ9NX94 342 aa28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
CYB561-211ENST00000580691 RAB11FIP3O75154 756 aa28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 FAM83AQ86UY5 434 aa28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 ABCF2Q9UG63 623 aa28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.13■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 ERICH6Q7L0X2 663 aa28.12■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 KIF1BPQ96EK5 621 aa28.12■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 HMG20BQ9P0W2 317 aa28.12■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa28.12■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 CA12O43570 354 aa28.11■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 GSTO1P78417 241 aa28.11■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 MAP3K11Q16584 847 aa28.1■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.1■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.1■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 LDHCP07864 332 aa28.09■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 SLC10A3P09131 477 aa28.09■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 RHPN1Q8TCX5 695 aa28.09■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.08■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 AOX1Q06278 1338 aa28.08■■■□□ 2.09
CYB561-211ENST00000580691 UBE2Q2LH0YL09 131 aa28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 AOC2O75106 756 aa28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 MCAMP43121 646 aa28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 SIRT2Q8IXJ6 389 aa28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
CYB561-211ENST00000580691 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms