RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 DLGAP3O95886 979 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 PLCL1Q15111 1095 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF792Q3KQV3 632 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM40Q8WWA1 233 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 NXPE3Q969Y0 559 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 ZBTB39O15060 712 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 ACPPP15309 386 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 MISP3Q96FF7 219 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 SLC38A3Q99624 504 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRM-204ENST00000577468 IGSF3O75054 1194 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 PCSK2P16519 638 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF765Q7L2R6 523 aa4.46□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 CLUAP1Q96AJ1 413 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 HHIPQ96QV1 700 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 TRPA1O75762 1119 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 NFICP08651 508 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ADH5P11766 374 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 FAM69CQ0P6D2 419 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 TTC16Q8NEE8 873 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM168AQ92567 244 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 FUT4P22083 530 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 FGD1P98174 961 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 GSTM4Q03013 218 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 WFDC3Q8IUB2 231 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA6CQ9H3T2 930 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ACSS3Q9H6R3 686 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ACTL7BQ9Y614 415 aa4.44□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 CYP27C1Q4G0S4 372 aa4.43□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 CHRDQ9H2X0 955 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 CYP11A1P05108 521 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 RAB6AP20340 208 aa4.42□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 DYMQ7RTS9 669 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 NRSN2Q9GZP1 204 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 C1GALT1Q9NS00 363 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 VAV3Q9UKW4 847 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa4.42□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 PI4K2BQ8TCG2 481 aa4.41□□□□□ -1.7
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PTPRM-204ENST00000577468 FAM53CQ9NYF3 392 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRM-204ENST00000577468 CD8BP10966 210 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 MAOBP27338 520 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 ASPAP45381 313 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 PRKCQQ04759 706 aa4.4□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 EREGO14944 169 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 PHACTR2O75167 634 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRM-204ENST00000577468 PDGFAP04085 211 aa4.39□□□□□ -1.71
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