RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 SUCLG2Q96I99 432 aa19.56■□□□□ 0.72
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SPNS2-208ENST00000576635 ALDH1L1O75891 902 aa19.55■□□□□ 0.72
SPNS2-208ENST00000576635 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP19.55■□□□□ 0.72
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SPNS2-208ENST00000576635 KAZALD1Q96I82 304 aa19.55■□□□□ 0.72
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SPNS2-208ENST00000576635 GRIK5Q16478 980 aa19.54■□□□□ 0.72
SPNS2-208ENST00000576635 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.54■□□□□ 0.72
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SPNS2-208ENST00000576635 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
SPNS2-208ENST00000576635 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa19.53■□□□□ 0.72
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SPNS2-208ENST00000576635 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP19.51■□□□□ 0.71
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SPNS2-208ENST00000576635 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa19.45■□□□□ 0.7
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SPNS2-208ENST00000576635 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 ZDHHC15Q96MV8 337 aa19.44■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 WRNIP1Q96S55 665 aa19.44■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 TMEM106CQ9BVX2 250 aa19.44■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 TMOD2Q9NZR1 351 aa19.44■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGEF6Q15052 776 aa19.43■□□□□ 0.7
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SPNS2-208ENST00000576635 FAM9BQ8IZU0 186 aa19.43■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa19.43■□□□□ 0.7
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SPNS2-208ENST00000576635 FKBP1CQ5VVH2 108 aa19.41■□□□□ 0.7
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SPNS2-208ENST00000576635 MRIQ9BWK5 157 aa19.41■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 MAST3O60307 1309 aa19.41■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 ZNF521Q96K83 1311 aa19.41■□□□□ 0.7
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SPNS2-208ENST00000576635 SNAPC2Q13487 334 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 HHIPL2Q6UWX4 724 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 SH3TC2Q8TF17 1288 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 KIF16BQ96L93 1317 aa19.4■□□□□ 0.7
SPNS2-208ENST00000576635 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP19.39■□□□□ 0.69
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