RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576505.6

CIC-209, Transcript of capicua transcriptional repressor, humanhuman

TSL 3

Gene CIC, Length 1,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIC-209ENST00000576505 LPIN2Q92539 896 aa22.25■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 MIER1Q8N108 512 aa22.24■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 FBXO3Q9UK99 471 aa22.24■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 CIAO1O76071 339 aa22.23■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 MAP3K11Q16584 847 aa22.23■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.23■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.23■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 TM4SF4P48230 202 aa22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 ATP2B3Q16720 1220 aa22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 SPRYD7Q5W111 196 aa22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 TEKT1Q969V4 418 aa22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.21■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 GNAI3P08754 354 aa22.21■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 SREBF2Q12772 1141 aa22.21■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.21■■□□□ 1.15
CIC-209ENST00000576505 BCAR3O75815 825 aa22.2■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TBC1D8O95759 1140 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TRIM27P14373 513 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TNNI2P48788 182 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 COPRSQ9NQ92 184 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 MAST3O60307 1309 aa22.19■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 UNCXA6NJT0 531 aa22.18■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.18■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.18■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TNNQ9UQP3 1299 aa22.18■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.18■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 CDAN1Q8IWY9 1227 aa22.17■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 WNK4Q96J92 1243 aa22.17■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TEPSINQ96N21 525 aa22.17■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 MRIQ9BWK5 157 aa22.17■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 SRGAP3O43295 1099 aa22.16■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 CACNB3P54284 484 aa22.16■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.16■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.16■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.16■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.15■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 PHKA1P46020 1223 aa22.14■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 INHBEP58166 350 aa22.14■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 MTX1Q13505 466 aa22.14■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.14
CIC-209ENST00000576505 ADORA1P30542 326 aa22.13■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 OTOFQ9HC10 1997 aa22.13■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 GPR25O00155 361 aa22.12■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 ALDH1A1P00352 501 aa22.12■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 GNAI2P04899 355 aa22.12■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 ELP3Q9H9T3 547 aa22.12■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.12■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 SEMA3EO15041 775 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 PRDX5P30044 214 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 GJA5P36382 358 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 TIMM10P62072 90 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 TFCP2Q12800 502 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 CCDC102BQ68D86 513 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 FAM83AQ86UY5 434 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 IFNL1Q8IU54 200 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.11■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 OPTNQ96CV9 577 aa22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.1■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 MAP3K9P80192 1104 aa22.09■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.09■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 LAMB1P07942 1786 aa22.09■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 A0A1B0GUL7 405 aa22.08■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 VGLL4Q14135 290 aa22.08■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.135e-10■■■■■ 29.1
CIC-209ENST00000576505 HOOK2Q96ED9 719 aa22.08■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 CSADQ9Y600 493 aa22.08■■□□□ 1.13
CIC-209ENST00000576505 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.07■■□□□ 1.12
CIC-209ENST00000576505 FKTNO75072 461 aa22.07■■□□□ 1.12
CIC-209ENST00000576505 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.07■■□□□ 1.12
CIC-209ENST00000576505 XAGE2Q96GT9 111 aa22.07■■□□□ 1.12
CIC-209ENST00000576505 RASGRF1Q13972 1273 aa22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms