RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574099.1

CCDC40-211, Transcript of coiled-coil domain containing 40, humanhuman

TSL 4

Gene CCDC40, Length 537 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC40-211ENST00000574099 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.29■■□□□ 1.16
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CCDC40-211ENST00000574099 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.28■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 GYG1P46976 350 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 GTF2A2P52657 109 aa22.27■■□□□ 1.16
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CCDC40-211ENST00000574099 SERPINA10Q9UK55 444 aa22.27■■□□□ 1.16
CCDC40-211ENST00000574099 CSADQ9Y600 493 aa22.27■■□□□ 1.16
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CCDC40-211ENST00000574099 MAP3K9P80192 1104 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 ARHGEF6Q15052 776 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.26■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 FANCIQ9NVI1 1328 aa22.26■■□□□ 1.15
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CCDC40-211ENST00000574099 CCDC27Q2M243 656 aa22.25■■□□□ 1.15
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CCDC40-211ENST00000574099 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.25■■□□□ 1.15
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CCDC40-211ENST00000574099 BEND3Q5T5X7 828 aa22.24■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 CACNB3P54284 484 aa22.23■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 GRIK5Q16478 980 aa22.23■■□□□ 1.15
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CCDC40-211ENST00000574099 H0YGN5 161 aa22.22■■□□□ 1.15
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CCDC40-211ENST00000574099 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 VAMP4O75379 141 aa22.21■■□□□ 1.15
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CCDC40-211ENST00000574099 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.21■■□□□ 1.15
CCDC40-211ENST00000574099 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 KIF22Q14807 665 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 WRNIP1Q96S55 665 aa22.2■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 BTBD19C9JJ37 291 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 TLR2O60603 784 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 CETPP11597 493 aa22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
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CCDC40-211ENST00000574099 IRF6O14896 467 aa22.17■■□□□ 1.14
CCDC40-211ENST00000574099 ERO1BQ86YB8 467 aa22.17■■□□□ 1.14
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CCDC40-211ENST00000574099 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.16■■□□□ 1.14
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CCDC40-211ENST00000574099 MTFR1Q15390 333 aa22.15■■□□□ 1.14
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CCDC40-211ENST00000574099 CTGFP29279 349 aa22.14■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 PPIL2Q13356 520 aa22.14■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 DPF3Q92784 378 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.13■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 GNRH1P01148 92 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 PSMC4P43686 418 aa22.12■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 LRRC24Q50LG9 513 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa22.12■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 ALDH1L1O75891 902 aa22.11■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 METTL24Q5JXM2 366 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 C17orf99Q6UX52 265 aa22.11■■□□□ 1.13
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CCDC40-211ENST00000574099 TRIM47Q96LD4 638 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 SZT2Q5T011 3432 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 AK9Q5TCS8 1911 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 OSBPP22059 807 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 DCAF15Q66K64 600 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 RAET1EQ8TD07 263 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 HOOK2Q96ED9 719 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC40-211ENST00000574099 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.1■■□□□ 1.13
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