RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 GJA5P36382 358 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 OPTNQ96CV9 577 aa26.69■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 PDE8BO95263 885 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 CRHR2Q13324 411 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 LRRC24Q50LG9 513 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 OTOP1Q7RTM1 612 aa26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPRCP08575 1304 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 MAP3K9P80192 1104 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 TEPSINQ96N21 525 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 TEKT1Q969V4 418 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPN18Q99952 460 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 CSADQ9Y600 493 aa26.66■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 SP3Q02447 781 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.65■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 GTF2A2P52657 109 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 CD99L2Q8TCZ2 262 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 MRIQ9BWK5 157 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 EFCC1Q9HA90 598 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 PTPN22Q9Y2R2 807 aa26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF521Q96K83 1311 aa26.64■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 BCAMP50895 628 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 GRIK5Q16478 980 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 CDAN1Q8IWY9 1227 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 E9PSI1 815 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 VGLL4Q14135 290 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 ARHGEF6Q15052 776 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 HOOK2Q96ED9 719 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 USP44Q9H0E7 712 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa26.62■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 CCL15Q16663 113 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 MAST3O60307 1309 aa26.61■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 CACNB3P54284 484 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 OTUD5Q96G74 571 aa26.6■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM83AQ86UY5 434 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.59■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 PCDH10Q9P2E7 1040 aa26.58■■□□□ 1.85
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC5A1P13866 664 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF16BQ96L93 1317 aa26.57■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 EYA2O00167 538 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FGFR2P21802 821 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ERO1BQ86YB8 467 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 WDR66Q8TBY9 1149 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 LPIN2Q92539 896 aa26.56■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 CETPP11597 493 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 DCAF15Q66K64 600 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 WRNIP1Q96S55 665 aa26.55■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 POTEFA5A3E0 1075 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SLFN5Q08AF3 891 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.54■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 LAMB1P07942 1786 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 NBPF11Q86T75 865 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ARMC5Q96C12 935 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.53■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SNAPC2Q13487 334 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 KIF22Q14807 665 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.52■■□□□ 1.84
SLC12A4-208ENST00000572010 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.51■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 OTOFQ9HC10 1997 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 GCC1Q96CN9 775 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 CEP126Q9P2H0 1117 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 FBXO3Q9UK99 471 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.5■■□□□ 1.83
SLC12A4-208ENST00000572010 IRF6O14896 467 aa26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms