RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	SPRYD7	Q5W111	196 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	LPIN2	Q92539	896 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		31.61	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	TM4SF4	P48230	202 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	TNNI2	P48788	182 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	TEKT1	Q969V4	418 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	FGFR2	P21802	821 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K11	Q16584	847 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PPP4C-208	ENST00000564966	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	31.57	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	MEIS3	Q99687	375 aa		31.57	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	MAST3	O60307	1309 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	ATP2B3	Q16720	1220 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.56	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	WNK4	Q96J92	1243 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		31.56	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		31.55	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	CIAO1	O76071	339 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	CACNB3	P54284	484 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO3	Q9UK99	471 aa		31.54	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	31.53	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		31.53	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	UNCX	A6NJT0	531 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	GNAI3	P08754	354 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	ELP3	Q9H9T3	547 aa		31.52	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		31.51	■■■□□ 2.64
PPP4C-208	ENST00000564966	GPR25	O00155	361 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	ALDH1A1	P00352	501 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	INHBE	P58166	350 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		31.51	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	31.5	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	TEPSIN	Q96N21	525 aa		31.5	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	SRGAP3	O43295	1099 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	31.48	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	31.48	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	IFNL1	Q8IU54	200 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		31.48	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	BCAR3	O75815	825 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	MRI	Q9BWK5	157 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	COPRS	Q9NQ92	184 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	CSAD	Q9Y600	493 aa		31.47	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	FKTN	O75072	461 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	OPTN	Q96CV9	577 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		31.46	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM27	P14373	513 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	31.45	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	MIER1	Q8N108	512 aa		31.45	■■■□□ 2.63
PPP4C-208	ENST00000564966	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	GJA5	P36382	358 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	PHKA1	P46020	1223 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	MAP3K9	P80192	1104 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	TNN	Q9UQP3	1299 aa		31.44	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	OTOF	Q9HC10	1997 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	31.43	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	HOOK2	Q96ED9	719 aa		31.43	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	PRDX5	P30044	214 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	ADORA1	P30542	326 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	SOX10	P56693	466 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	VGLL4	Q14135	290 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		31.42	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	GNAI2	P04899	355 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	31.41	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM83A	Q86UY5	434 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	OTUD5	Q96G74	571 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		31.41	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	SEMA3E	O15041	775 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	TIMM10	P62072	90 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	TFCP2	Q12800	502 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC102B	Q68D86	513 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		31.4	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	WRNIP1	Q96S55	665 aa		31.39	■■■□□ 2.62
PPP4C-208	ENST00000564966	RGS19	P49795	217 aa		31.38	■■■□□ 2.61

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