RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564566.1

USP10-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

TSL 4

Gene USP10, Length 561 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-211ENST00000564566 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 TNNI2P48788 182 aa21.44■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 CAP1Q01518 475 aa21.44■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 SUCLG2Q96I99 432 aa21.44■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.43■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 ALDH1L1O75891 902 aa21.42■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.42■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.41■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.41■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 GTF2A2P52657 109 aa21.41■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 MAP3K9P80192 1104 aa21.41■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.41■■□□□ 1.02
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USP10-211ENST00000564566 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.4■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.4■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.4■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 BRCA2P51587 3418 aa21.39■■□□□ 1.02
USP10-211ENST00000564566 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
USP10-211ENST00000564566 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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USP10-211ENST00000564566 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.38■■□□□ 1.01
USP10-211ENST00000564566 TEKT1Q969V4 418 aa21.38■■□□□ 1.01
USP10-211ENST00000564566 ZNF333Q96JL9 665 aa21.38■■□□□ 1.01
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USP10-211ENST00000564566 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.38■■□□□ 1.01
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USP10-211ENST00000564566 WRNIP1Q96S55 665 aa21.37■■□□□ 1.01
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USP10-211ENST00000564566 PDE8BO95263 885 aa21.32■■□□□ 1
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USP10-211ENST00000564566 DCAF15Q66K64 600 aa21.31■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.31■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 HOOK2Q96ED9 719 aa21.31■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 AK9Q5TCS8 1911 aa21.31■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 PPIL2Q13356 520 aa21.3■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 MIGA2Q7L4E1 593 aa21.3■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 FAM83AQ86UY5 434 aa21.3■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 ZNF341Q9BYN7 854 aa21.29■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
USP10-211ENST00000564566 CPA4Q9UI42 421 aa21.28■■□□□ 1
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