RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 NEUROD6Q96NK8 337 aa38.02■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 WBP1LQ9NX94 342 aa38.02■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP38.01■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 MOB2Q70IA6 237 aa38.01■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 XAGE2Q96GT9 111 aa38.01■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP38.01■■■■□ 3.68
CMTM4-204ENST00000563952 FOXN1O15353 648 aa38■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 MAP2K2P36507 400 aa38■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 TEKT1Q969V4 418 aa38■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 DENND2AQ9ULE3 1009 aa38■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa38■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 MAST3O60307 1309 aa37.99■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP37.99■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 COG6Q9Y2V7 657 aa37.99■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 SEMA3EO15041 775 aa37.98■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 SURF6O75683 361 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 MVPQ14764 893 aaKnown RBP37.98■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 SPDYE2Q495Y8 402 aa37.98■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 UBE2Q2LH0YL09 131 aa37.97■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 PRKG1Q13976 671 aa37.97■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa37.97■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 CEP85Q6P2H3 762 aa37.96■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC102AQ96A19 550 aa37.96■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 NOGQ13253 232 aa37.95■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 GORABQ5T7V8 394 aa37.95■■■■□ 3.67
CMTM4-204ENST00000563952 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 RASGRF1Q13972 1273 aa37.94■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 BEGAINQ9BUH8 593 aa37.94■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 DDX19BQ9UMR2 479 aa37.94■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 TNFAIP1Q13829 316 aa37.93■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 RASA3Q14644 834 aa37.93■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 ZDHHC15Q96MV8 337 aa37.93■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 ZIC5Q96T25 663 aa37.93■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 MRIQ9BWK5 157 aa37.93■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 LDHBP07195 334 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 PRDX5P30044 214 aa37.92■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP37.92■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 SALL1Q9NSC2 1324 aa37.91■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 TCP10L2B9ZVM9 353 aa37.91■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 ARMC9Q7Z3E5 817 aa37.91■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 SLC10A3P09131 477 aa37.9■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 HHIPL2Q6UWX4 724 aa37.9■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP37.9■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 FZD1Q9UP38 647 aa37.9■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP37.9■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 RASAL3Q86YV0 1011 aa37.89■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP37.89■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 SSC5DA1L4H1 1573 aa37.89■■■■□ 3.66
CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB22O15209 634 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 CACNB3P54284 484 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 DIXDC1Q155Q3 683 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 TNNI3KQ59H18 835 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 C20orf194Q5TEA3 1177 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa37.88■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP37.87■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 GPR108Q9NPR9 543 aa37.87■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 TMOD2Q9NZR1 351 aa37.87■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 TNNI2P48788 182 aa37.86■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 ABCF2Q9UG63 623 aa37.86■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP37.86■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa37.85■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa37.85■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP37.84■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 LBX1P52954 281 aa37.84■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 PDE3AQ14432 1141 aa37.84■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 TMEM39BQ9GZU3 492 aa37.84■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP37.84■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP37.83■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 HMG20BQ9P0W2 317 aa37.83■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa37.83■■■■□ 3.65
CMTM4-204ENST00000563952 PI16Q6UXB8 463 aa37.82■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP37.82■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 SPATA5Q8NB90 893 aa37.82■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 DBNDD2Q9BQY9 259 aa37.82■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP37.82■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP37.81■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 CDAN1Q8IWY9 1227 aa37.81■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 TSKSQ9UJT2 592 aa37.81■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa37.8■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 LDLRAD1Q5T700 205 aa37.8■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP37.8■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 TEPSINQ96N21 525 aa37.8■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 TTC39AQ5SRH9 613 aa37.79■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 MYH2Q9UKX2 1941 aa37.79■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 MCAMP43121 646 aa37.78■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP37.78■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 MAP3K11Q16584 847 aa37.78■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 CCDC158Q5M9N0 1113 aa37.78■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 PRDM10Q9NQV6 1147 aa37.78■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa37.77■■■■□ 3.64
CMTM4-204ENST00000563952 ERICH6Q7L0X2 663 aa37.77■■■■□ 3.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms