RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3R5Q8WYR1 880 aa6.32□□□□□ -1.4
FAM227B-211ENST00000560557 HHIPQ96QV1 700 aa6.32□□□□□ -1.4
FAM227B-211ENST00000560557 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.32□□□□□ -1.4
FAM227B-211ENST00000560557 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
FAM227B-211ENST00000560557 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 PRKCQQ04759 706 aa6.31□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 RELTQ969Z4 430 aa6.31□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 TRPA1O75762 1119 aa6.3□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.3□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.3□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.29□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 U3KQE9 123 aa6.29□□□□□ -1.4
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FAM227B-211ENST00000560557 USP17L10C9JJH3 530 aa6.25□□□□□ -1.41
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FAM227B-211ENST00000560557 CD320Q9NPF0 282 aa6.25□□□□□ -1.41
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FAM227B-211ENST00000560557 KCNA10Q16322 511 aa6.24□□□□□ -1.41
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FAM227B-211ENST00000560557 CTNND2Q9UQB3 1225 aa6.24□□□□□ -1.41
FAM227B-211ENST00000560557 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa6.24□□□□□ -1.41
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FAM227B-211ENST00000560557 FAM87AP0C7U9 286 aa6.22□□□□□ -1.41
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FAM227B-211ENST00000560557 GSTM4Q03013 218 aa6.22□□□□□ -1.41
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FAM227B-211ENST00000560557 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
FAM227B-211ENST00000560557 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.22□□□□□ -1.41
FAM227B-211ENST00000560557 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.21□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 C16orf46Q6P387 395 aa6.21□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 MKNK2Q9HBH9 465 aa6.21□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.21□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa6.21□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 CEACAM5P06731 702 aa6.2□□□□□ -1.42
FAM227B-211ENST00000560557 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
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