RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558324.1

HERC1-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 5

Gene HERC1, Length 828 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-202ENST00000558324 SPDYE2Q495Y8 402 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 RNF186Q9NXI6 227 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.84□□□□□ -0.03
HERC1-202ENST00000558324 TCP10L2B9ZVM9 353 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 IL15P40933 162 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 FBXO3Q9UK99 471 aa14.83□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TNFAIP1Q13829 316 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TMEM57Q8N5G2 664 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TEKT1Q969V4 418 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 COPRSQ9NQ92 184 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.82□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 GNAI2P04899 355 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 ADORA1P30542 326 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 CACNB3P54284 484 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 ABHD8Q96I13 439 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.81□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 PHKA1P46020 1223 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TMEM39BQ9GZU3 492 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 MAST3O60307 1309 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.8□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TNNI2P48788 182 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TFCP2Q12800 502 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 MTX1Q13505 466 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.79□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 PRDX5P30044 214 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TIMM10P62072 90 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 DGKZQ13574 1117 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 MAP3K11Q16584 847 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 SPRYD7Q5W111 196 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 CCDC102BQ68D86 513 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 ZDHHC15Q96MV8 337 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TEPSINQ96N21 525 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 MCOLN1Q9GZU1 580 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 TMOD2Q9NZR1 351 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa14.78□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.77□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.77□□□□□ -0.04
HERC1-202ENST00000558324 A0A1B0GUL7 405 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 TBC1D8O95759 1140 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 SREBF2Q12772 1141 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 WNK4Q96J92 1243 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 RLBP1P12271 317 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 HHIPL2Q6UWX4 724 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 XAGE2Q96GT9 111 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 ELP3Q9H9T3 547 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa14.76□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 SEMA3EO15041 775 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 TM4SF4P48230 202 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 RASGRF1Q13972 1273 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.75□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 OTOFQ9HC10 1997 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 GJA5P36382 358 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 GORABQ5T7V8 394 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 MRIQ9BWK5 157 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 ABCF2Q9UG63 623 aa14.74□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 TCP10Q12799 353 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 VGLL4Q14135 290 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 OPTNQ96CV9 577 aa14.73□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 UNCXA6NJT0 531 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 NFIAQ12857 509 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 FAM83AQ86UY5 434 aa14.72□□□□□ -0.05
HERC1-202ENST00000558324 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.1 ms