RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557400.5

NEDD1-210, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD1, Length 604 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-210ENST00000557400 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 PTPN18Q99952 460 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 PCDH10Q9P2E7 1040 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.54■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 TNNI2P48788 182 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 METTL24Q5JXM2 366 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 CD99L2Q8TCZ2 262 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.53■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 GRIK5Q16478 980 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 LRRC24Q50LG9 513 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 CAVIN4Q5BKX8 364 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 MS4A4AQ96JQ5 239 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 PTPN22Q9Y2R2 807 aa21.52■■□□□ 1.04
NEDD1-210ENST00000557400 HTTP42858 3142 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 SP3Q02447 781 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 VGLL4Q14135 290 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 EFCC1Q9HA90 598 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF521Q96K83 1311 aa21.51■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 PDE8BO95263 885 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 MAP3K9P80192 1104 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 VGLL2Q8N8G2 317 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 TEKT1Q969V4 418 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 CSADQ9Y600 493 aa21.5■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 LAMB1P07942 1786 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 GTF2A2P52657 109 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 BRI3BPQ8WY22 251 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 PTPRCP08575 1304 aa21.49■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 POTEFA5A3E0 1075 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 CCL15Q16663 113 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ARMC5Q96C12 935 aa21.48■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 BCAMP50895 628 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 CACNB3P54284 484 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 OTUD5Q96G74 571 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 MRIQ9BWK5 157 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 KIF16BQ96L93 1317 aa21.47■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 CAP1Q01518 475 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 MAST3O60307 1309 aa21.46■■□□□ 1.03
NEDD1-210ENST00000557400 SPDYE5A6NIY4 337 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 ARHGEF6Q15052 776 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 FAM83AQ86UY5 434 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 HOOK2Q96ED9 719 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 USP44Q9H0E7 712 aa21.45■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 FGFR2P21802 821 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 WRNIP1Q96S55 665 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 OTOFQ9HC10 1997 aa21.44■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 ERO1BQ86YB8 467 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.43■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 E9PSI1 815 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 CETPP11597 493 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 GCC1Q96CN9 775 aa21.42■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 EYA2O00167 538 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 DCAF15Q66K64 600 aa21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 SLC5A1P13866 664 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 SNAPC2Q13487 334 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 LPIN2Q92539 896 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 ZNF333Q96JL9 665 aa21.4■■□□□ 1.02
NEDD1-210ENST00000557400 IRF6O14896 467 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 TLR2O60603 784 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 EN2P19622 333 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 PPIL2Q13356 520 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 NBPF11Q86T75 865 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 TMEM106CQ9BVX2 250 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa21.39■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
NEDD1-210ENST00000557400 BTBD19C9JJ37 291 aa21.38■■□□□ 1.01
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