RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556975.5

TMEM260-214, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 4

Gene TMEM260, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-214ENST00000556975 SPDYE2Q495Y8 402 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM260-214ENST00000556975 LDLRAD1Q5T700 205 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM260-214ENST00000556975 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM260-214ENST00000556975 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.21■■■□□ 2.11
TMEM260-214ENST00000556975 VEZTQ9HBM0 779 aa28.21■■■□□ 2.11
TMEM260-214ENST00000556975 MAP3K11Q16584 847 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 ATP2B3Q16720 1220 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.2■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 ZBTB22O15209 634 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 SRGAP3O43295 1099 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 TNFAIP1Q13829 316 aa28.19■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 GNAI2P04899 355 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 RASA3Q14644 834 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.18■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 UNCXA6NJT0 531 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 PRKG1Q13976 671 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 RNF186Q9NXI6 227 aa28.17■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 SSC5DA1L4H1 1573 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 AKAP11Q9UKA4 1901 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP28.16■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 TMEM57Q8N5G2 664 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 TEKT1Q969V4 418 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 MAST3O60307 1309 aa28.16■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.15■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.14■■■□□ 2.1
TMEM260-214ENST00000556975 SEMA3EO15041 775 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TRPA1O75762 1119 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TM4SF4P48230 202 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 FZD1Q9UP38 647 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 MYH13Q9UKX3 1938 aa28.13■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TEPSINQ96N21 525 aa28.12■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 CCDC85CA6NKD9 419 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 USP2O75604 605 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 PHKA1P46020 1223 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TNNI2P48788 182 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 DENND2AQ9ULE3 1009 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 AKAP2Q9Y2D5 859 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 SALL1Q9NSC2 1324 aa28.11■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TIMM10P62072 90 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 SPRYD7Q5W111 196 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 CCDC102BQ68D86 513 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 SLC10A4Q96EP9 437 aa28.1■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 ADORA1P30542 326 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 IREB2P48200 963 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 TFCP2Q12800 502 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.09■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 A0A1B0GUL7 405 aa28.08■■■□□ 2.09
TMEM260-214ENST00000556975 SREBF2Q12772 1141 aa28.07■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 FAM83AQ86UY5 434 aa28.07■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.07■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP28.06■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 XAGE2Q96GT9 111 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 CLMNQ96JQ2 1002 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.06■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 LDHBP07195 334 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 RLBP1P12271 317 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 PRDX5P30044 214 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 POLA2Q14181 598 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 INHBEP58166 350 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 ATP8B2P98198 1209 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 SSH3Q8TE77 659 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 WNK4Q96J92 1243 aa28.04■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 CACNB3P54284 484 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 MCOLN1Q9GZU1 580 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa28.03■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 RASGRF1Q13972 1273 aa28.02■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.02■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 CFHR5Q9BXR6 569 aa28.02■■■□□ 2.08
TMEM260-214ENST00000556975 DIXDC1Q155Q3 683 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.01■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 DGKZQ13574 1117 aa28■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 LAMB1P07942 1786 aa28■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 MAP3K9P80192 1104 aa27.99■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa27.99■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP27.99■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP27.99■■■□□ 2.07
TMEM260-214ENST00000556975 HOOK2Q96ED9 719 aa27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms