RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-233ENST00000552688 PRMT2P55345 433 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CCL15Q16663 113 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 BEND3Q5T5X7 828 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 LMBR1LQ6UX01 489 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 MRIQ9BWK5 157 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 PLIN1O60240 522 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TLR2O60603 784 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 VAMP4O75379 141 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ALDH1L1O75891 902 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 CETPP11597 493 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 VGLL4Q14135 290 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 VPS37DQ86XT2 251 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 ERO1BQ86YB8 467 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 WDR63Q8IWG1 891 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TEPSINQ96N21 525 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-233ENST00000552688 MROH5Q6ZUA9 1318 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SPDYE5A6NIY4 337 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CRKP46108 304 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SNAPC2Q13487 334 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CAVIN4Q5BKX8 364 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FKBP1CQ5VVH2 108 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FAM83AQ86UY5 434 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FAM43AQ8N2R8 423 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 TMEM39BQ9GZU3 492 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 TMOD2Q9NZR1 351 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 JAG2Q9Y219 1238 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 AOX1Q06278 1338 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FANCIQ9NVI1 1328 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 MYH3P11055 1940 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 F6X3S4 739 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 HOXD10P28358 340 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 GYG1P46976 350 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 DCAF15Q66K64 600 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FBXO33Q7Z6M2 555 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 TEKT1Q969V4 418 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 OTUD5Q96G74 571 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 MAST3O60307 1309 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CAPN2P17655 700 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CAP1Q01518 475 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 PPATQ06203 517 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 PPIL2Q13356 520 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CDCA7LQ96GN5 454 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 ZDHHC15Q96MV8 337 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 FOXD4L1Q9NU39 408 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 BTBD19C9JJ37 291 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 IRF6O14896 467 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 HHIPL2Q6UWX4 724 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 C17orf99Q6UX52 265 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 WRNIP1Q96S55 665 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa8.61□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 UTYO14607 1347 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 KIF16BQ96L93 1317 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 H0YGN5 161 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 PDE8BO95263 885 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 TRIM47Q96LD4 638 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 ZNF341Q9BYN7 854 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SRRDQ9UH36 339 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 LAMB1P07942 1786 aa8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 SPEF2Q9C093 1822 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 ZNF521Q96K83 1311 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 GJB1P08034 283 aa8.59□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
CS-233ENST00000552688 GRK4P32298 578 aa8.59□□□□□ -1.03
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