RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 CACNB3P54284 484 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 CCL15Q16663 113 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 GCC1Q96CN9 775 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 TEPSINQ96N21 525 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa20.43■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 GRM8O00222 908 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 CRKP46108 304 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 ARMC5Q96C12 935 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 OTUD5Q96G74 571 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.42■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 UNCXA6NJT0 531 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 TNFAIP1Q13829 316 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 VGLL4Q14135 290 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 SUCLG2Q96I99 432 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.41■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 MAP3K9P80192 1104 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.4■□□□□ 0.86
CS-227ENST00000551441 UBE4AQ14139 1066 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.39■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.38■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 ZNF333Q96JL9 665 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 CSADQ9Y600 493 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.38■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 TNNI2P48788 182 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 GTF2A2P52657 109 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 VPS37DQ86XT2 251 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 SH3TC2Q8TF17 1288 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 KAZALD1Q96I82 304 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 MRS2Q9HD23 443 aa20.37■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 LRRC24Q50LG9 513 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 WDR63Q8IWG1 891 aa20.36■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.35■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.34■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.34■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 WRNIP1Q96S55 665 aa20.34■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 BTBD19C9JJ37 291 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 ALDH1L1O75891 902 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 BCAMP50895 628 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 METTL24Q5JXM2 366 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 NBPF11Q86T75 865 aa20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CS-227ENST00000551441 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.32■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 MROH5Q6ZUA9 1318 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 IRF6O14896 467 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 ARHGEF6Q15052 776 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 TEKT1Q969V4 418 aa20.31■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 TLR2O60603 784 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 CETPP11597 493 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 CPA4Q9UI42 421 aa20.3■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 CTGFP29279 349 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 INPP5BP32019 993 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 KIF22Q14807 665 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 ERO1BQ86YB8 467 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.29■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 AK9Q5TCS8 1911 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 H0YGN5 161 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 SNAPC2Q13487 334 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 MTFR1Q15390 333 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.28■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 PDE8BO95263 885 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 TCP10Q12799 353 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.27■□□□□ 0.84
CS-227ENST00000551441 PPIL2Q13356 520 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.26■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 CEP290O15078 2479 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 FAM83AQ86UY5 434 aa20.25■□□□□ 0.83
CS-227ENST00000551441 FAM9BQ8IZU0 186 aa20.25■□□□□ 0.83
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