RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TFCP2Q12800 502 aa9.62□□□□□ -0.87
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PTPRB-208ENST00000550358 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-208ENST00000550358 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
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PTPRB-208ENST00000550358 UFL1O94874 794 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRB-208ENST00000550358 BAG6P46379 1132 aa9.59□□□□□ -0.87
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