RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548015.1

KRT18-204, Transcript of keratin 18, human

TSL 2

Gene KRT18, Length 928 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KRT18-204	ENST00000548015	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	PTPN18	Q99952	460 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	PTPRC	P08575	1304 aa		13.8	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	FGFR2	P21802	821 aa		13.79	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.78	□□□□□ -0.2
KRT18-204	ENST00000548015	SLC34A2	O95436	690 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	CAP1	Q01518	475 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	PSME4	Q14997	1843 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.77	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	EYA2	O00167	538 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	CACNB3	P54284	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.76	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	CRHR2	Q13324	411 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	HTT	P42858	3142 aa		13.75	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	VGLL4	Q14135	290 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.74	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	TNNI2	P48788	182 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	LPIN2	Q92539	896 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.73	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	MYH3	P11055	1940 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		13.72	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	SLC5A1	P13866	664 aa		13.71	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.71	□□□□□ -0.21
KRT18-204	ENST00000548015	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CIAO1	O76071	339 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	GTF2A2	P52657	109 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	SP3	Q02447	781 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CCL15	Q16663	113 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	ERO1A	Q96HE7	468 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	SIL1	Q9H173	461 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	EFCC1	Q9HA90	598 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.7	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	POTEF	A5A3E0	1075 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	NFIA	Q12857	509 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	MAST3	O60307	1309 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	BTBD19	C9JJ37	291 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	IRF6	O14896	467 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	PRDX5	P30044	214 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	PHKA1	P46020	1223 aa		13.68	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
KRT18-204	ENST00000548015	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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