RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 MYO1BO43795 1136 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 TDO2P48775 406 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 TRDNQ13061 729 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 BECN1Q14457 450 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 DPY19L2Q6NUT2 758 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 TICAM2Q86XR7 235 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 CERS3Q8IU89 383 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 POLLQ9UGP5 575 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF609O15014 1411 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 ECE2O60344 883 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 CHMLP26374 656 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 CIAPIN1Q6FI81 312 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 APPBP2Q92624 585 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 SYT17Q9BSW7 474 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 MED23Q9ULK4 1368 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 RAD50Q92878 1312 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 IGSF3O75054 1194 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 GNAT2P19087 354 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 PSMD1Q99460 953 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 ZNRF3Q9ULT6 936 aa6.77□□□□□ -1.32
PTPRO-210ENST00000544244 MCAMP43121 646 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 OLFM4Q6UX06 510 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 C10orf71Q711Q0 1435 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 SCN7AQ01118 1682 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 RREB1Q92766 1687 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 RAD17O75943 681 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 BACH2Q9BYV9 841 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 C22orf23Q9BZE7 217 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 NAPBQ9H115 298 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 MYO3BQ8WXR4 1341 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 H7C1D1 291 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 PDE6AP16499 860 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 UBE3CQ15386 1083 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 PI16Q6UXB8 463 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 LMNB1P20700 586 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 DLGAP5Q15398 846 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 STRIP1Q5VSL9 837 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 NUP188Q5SRE5 1749 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 MBD4O95243 580 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 KLRK1P26718 216 aa6.76□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 SCARF1Q14162 830 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 KRT32Q14532 448 aa6.75□□□□□ -1.33
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PTPRO-210ENST00000544244 C4AP0C0L4 1744 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 TEX11Q8IYF3 940 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 MINDY4BA8MYZ0 360 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 ST18O60284 1047 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 HLA-DOAP06340 250 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 IL1R1P14778 569 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 ADD2P35612 726 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 HSCBQ8IWL3 235 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 FAM227BQ96M60 508 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF213O14771 459 aa6.74□□□□□ -1.33
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