RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539613.5

RHBDD1-215, Transcript of rhomboid domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene RHBDD1, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1-215ENST00000539613 UBE4AQ14139 1066 aa26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 VPS37DQ86XT2 251 aa26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 WDR63Q8IWG1 891 aa26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 TMEM39BQ9GZU3 492 aa26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 VGLL4Q14135 290 aa26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 CCL15Q16663 113 aa26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 OTUD5Q96G74 571 aa26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 BRCA2P51587 3418 aa26.21■■□□□ 1.79
RHBDD1-215ENST00000539613 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 ARMC5Q96C12 935 aa26.2■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.2■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 EN2P19622 333 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 BRI3BPQ8WY22 251 aa26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 TEPSINQ96N21 525 aa26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 TMEM106CQ9BVX2 250 aa26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.19■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 ALDH1L1O75891 902 aa26.18■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 GTF2A2P52657 109 aa26.18■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa26.18■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 SUCLG2Q96I99 432 aa26.18■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.18■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 CACNB3P54284 484 aa26.17■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 MAP3K9P80192 1104 aa26.17■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 CAP1Q01518 475 aa26.17■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 ARHGEF6Q15052 776 aa26.17■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.16■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 TMOD2Q9NZR1 351 aa26.16■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa26.16■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 MYCP01106 439 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 GRIK5Q16478 980 aa26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 METTL24Q5JXM2 366 aa26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 TEKT1Q969V4 418 aa26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 AK9Q5TCS8 1911 aa26.15■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.14■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.14■■□□□ 1.78
RHBDD1-215ENST00000539613 NBPF11Q86T75 865 aa26.13■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa26.13■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF333Q96JL9 665 aa26.13■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 WRNIP1Q96S55 665 aa26.13■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 SPDYE5A6NIY4 337 aa26.11■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 KIF22Q14807 665 aa26.11■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 KAZALD1Q96I82 304 aa26.11■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.11■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 LRRC24Q50LG9 513 aa26.1■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa26.1■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 CETPP11597 493 aa26.09■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.09■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 MAST3O60307 1309 aa26.09■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 ANP32CO43423 234 aa26.08■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 ERO1BQ86YB8 467 aa26.08■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 HOOK2Q96ED9 719 aa26.08■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa26.08■■□□□ 1.77
RHBDD1-215ENST00000539613 SNAPC2Q13487 334 aa26.07■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 SH3TC2Q8TF17 1288 aa26.07■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 BTBD19C9JJ37 291 aa26.06■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 BCAMP50895 628 aa26.06■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 DCAF15Q66K64 600 aa26.06■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.06■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 ZDHHC15Q96MV8 337 aa26.06■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 IRF6O14896 467 aa26.05■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 TLR2O60603 784 aa26.05■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 PDE8BO95263 885 aa26.05■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 UTYO14607 1347 aa26.05■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 PPIL2Q13356 520 aa26.04■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM83AQ86UY5 434 aa26.04■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 FAM9BQ8IZU0 186 aa26.04■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.04■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 VGLL2Q8N8G2 317 aa26.04■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 MIGA2Q7L4E1 593 aa26.03■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 ZNF341Q9BYN7 854 aa26.03■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 DOCK2Q92608 1830 aa26.02■■□□□ 1.76
RHBDD1-215ENST00000539613 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms