RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		18.58	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		18.58	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	18.58	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	PSMD14	O00487	310 aa		18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	EPS15	P42566	896 aa		18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	RASGRF1	Q13972	1273 aa		18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	DACT2	Q5SW24	774 aa		18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	AIDA	Q96BJ3	306 aa		18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		18.57	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	PSME4	Q14997	1843 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730		H7C1D1	291 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	PDE1A	P54750	535 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	GSTO1	P78417	241 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	HAUS7	Q99871	368 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.56	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	MCAM	P43121	646 aa		18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	MAP3K12	Q12852	859 aa		18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	MRI	Q9BWK5	157 aa		18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	18.55	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	LDHC	P07864	332 aa		18.54	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	USP17L8	P0C7I0	530 aa		18.54	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	CST9	Q5W186	159 aa		18.54	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	CERS3	Q8IU89	383 aa		18.54	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	18.53	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		18.53	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		18.53	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	ABCF2	Q9UG63	623 aa		18.53	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	TRAF5	O00463	557 aa		18.52	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		18.52	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	18.52	■□□□□ 0.56
BBS1-224	ENST00000534730	SCN9A	Q15858	1988 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZAP70	P43403	619 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	EVI5L	Q96CN4	794 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ABHD8	Q96I13	439 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	GML	Q99445	158 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	18.51	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	MYO1B	O43795	1136 aa		18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TEKT1	Q969V4	418 aa		18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	CAPNS2	Q96L46	248 aa		18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	SNRK	Q9NRH2	765 aa		18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	RAI14	Q9P0K7	980 aa		18.5	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	HIP1	O00291	1037 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	GOLIM4	O00461	696 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	SCARF1	Q14162	830 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		18.49	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	DLGAP5	Q15398	846 aa		18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	MICALL2	Q8IY33	904 aa		18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	BAG3	O95817	575 aa		18.47	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PLCG2	P16885	1265 aa		18.47	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		18.47	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	JAG2	Q9Y219	1238 aa		18.47	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	18.46	■□□□□ 0.55	4e-6	■■■■□ 21.7
BBS1-224	ENST00000534730	CERS5	Q8N5B7	392 aa		18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	FSD1	Q9BTV5	496 aa		18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		18.46	■□□□□ 0.55
BBS1-224	ENST00000534730	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.54
BBS1-224	ENST00000534730		F8W031	263 aa	Predicted RBP	18.45	■□□□□ 0.54
BBS1-224	ENST00000534730	PRDX5	P30044	214 aa		18.45	■□□□□ 0.54
BBS1-224	ENST00000534730	CRK	P46108	304 aa		18.45	■□□□□ 0.54

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms