RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534404.1

LRP4-205, Transcript of LDL receptor related protein 4, human

TSL 5

Gene LRP4, Length 663 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRP4-205	ENST00000534404	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	40.89	■■■■■ 4.14
LRP4-205	ENST00000534404	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		40.89	■■■■■ 4.14
LRP4-205	ENST00000534404	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		40.89	■■■■■ 4.14
LRP4-205	ENST00000534404	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		40.88	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	ADORA1	P30542	326 aa		40.88	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	MAST3	O60307	1309 aa		40.88	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	AOX1	Q06278	1338 aa		40.88	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	PHKA1	P46020	1223 aa		40.87	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	40.87	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	40.87	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		40.87	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404		A0A1B0GUL7	405 aa		40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	ATP8B2	P98198	1209 aa		40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	DENND2A	Q9ULE3	1009 aa		40.86	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	TNFAIP1	Q13829	316 aa		40.85	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC102B	Q68D86	513 aa		40.85	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		40.84	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	ZIC5	Q96T25	663 aa		40.84	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	SEMA3E	O15041	775 aa		40.83	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	SLC10A3	P09131	477 aa		40.83	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	LBX1	P52954	281 aa		40.83	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	40.83	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	XAGE2	Q96GT9	111 aa		40.83	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	POLA2	Q14181	598 aa		40.82	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	RASA3	Q14644	834 aa		40.82	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		40.82	■■■■■ 4.13
LRP4-205	ENST00000534404	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	40.81	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	GORAB	Q5T7V8	394 aa		40.81	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	SSH3	Q8TE77	659 aa		40.81	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	MRI	Q9BWK5	157 aa		40.81	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	40.81	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	40.8	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		40.8	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		40.8	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		40.79	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	TNNI2	P48788	182 aa		40.79	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		40.79	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	40.79	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	40.78	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	40.78	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	40.78	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	TNS4	Q8IZW8	715 aa		40.78	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	CA12	O43570	354 aa		40.77	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	40.77	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		40.77	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	FZD1	Q9UP38	647 aa		40.77	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	IFFO2	Q5TF58	517 aa		40.76	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		40.76	■■■■■ 4.12
LRP4-205	ENST00000534404	PRDX5	P30044	214 aa		40.75	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	40.75	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	40.75	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	TSKS	Q9UJT2	592 aa		40.75	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		40.74	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	RASGRF1	Q13972	1273 aa		40.74	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	CACNB3	P54284	484 aa		40.72	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	40.72	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	COG6	Q9Y2V7	657 aa		40.72	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	CEP85	Q6P2H3	762 aa		40.71	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	ABCF2	Q9UG63	623 aa		40.71	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	ZBTB22	O15209	634 aa		40.7	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		40.7	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		40.7	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		40.7	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		40.69	■■■■■ 4.11
LRP4-205	ENST00000534404	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		40.69	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	40.69	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	40.68	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	40.68	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	CSRNP1	Q96S65	589 aa		40.68	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	MAP3K11	Q16584	847 aa		40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	GPR108	Q9NPR9	543 aa		40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		40.67	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	TNNI3K	Q59H18	835 aa		40.66	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	40.66	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		40.66	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	TEPSIN	Q96N21	525 aa		40.65	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	40.65	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	40.64	■■■■■ 4.1
LRP4-205	ENST00000534404	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		40.63	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	SPATA5	Q8NB90	893 aa		40.63	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		40.63	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	FAM83A	Q86UY5	434 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	SLF2	Q8IX21	1173 aa		40.62	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	TRPA1	O75762	1119 aa		40.61	■■■■■ 4.09
LRP4-205	ENST00000534404	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	40.61	■■■■■ 4.09

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms