RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526055.5

TSPAN4-216, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 469 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-216ENST00000526055 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 TEKT1Q969V4 418 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 DENND2AQ9ULE3 1009 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa22.84■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 CLRN2A0PK11 232 aa22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TSPAN4-216ENST00000526055 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 ATP8B2P98198 1209 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 POLA2Q14181 598 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 VEZTQ9HBM0 779 aa22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 A0A1B0GUL7 405 aa22.81■■□□□ 1.24
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TSPAN4-216ENST00000526055 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
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TSPAN4-216ENST00000526055 CCDC102BQ68D86 513 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 SSH3Q8TE77 659 aa22.81■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 PHKA1P46020 1223 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 MAP3K11Q16584 847 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 TNNI2P48788 182 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 LBX1P52954 281 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 TIMM10P62072 90 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 RASA3Q14644 834 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 AOX1Q06278 1338 aa22.79■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 ADORA1P30542 326 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 MOB2Q70IA6 237 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 XAGE2Q96GT9 111 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 GPR108Q9NPR9 543 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 MYH13Q9UKX3 1938 aa22.78■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 ZIC5Q96T25 663 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.77■■□□□ 1.24
TSPAN4-216ENST00000526055 LDHBP07195 334 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 PANK1Q8TE04 598 aa22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.75■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 CAPN15O75808 1086 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 PRDX5P30044 214 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 IREB2P48200 963 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 RASGRF1Q13972 1273 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM83AQ86UY5 434 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 CSRNP1Q96S65 589 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.74■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 PRKG1Q13976 671 aa22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 GORABQ5T7V8 394 aa22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 TEPSINQ96N21 525 aa22.73■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 CEP85Q6P2H3 762 aa22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 SLF2Q8IX21 1173 aa22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 HOOK2Q96ED9 719 aa22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.71■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.71■■□□□ 1.23
TSPAN4-216ENST00000526055 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 TNNI3KQ59H18 835 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 TM4SF4P48230 202 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 SREBF2Q12772 1141 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 PDE3AQ14432 1141 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 SPRYD7Q5W111 196 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 ERC1Q8IUD2 1116 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 RNF186Q9NXI6 227 aa22.69■■□□□ 1.22
TSPAN4-216ENST00000526055 GAKO14976 1311 aa22.68■■□□□ 1.22
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