RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525081.1

NSD3-204, Transcript of nuclear receptor binding SET domain protein 3, human

TSL 2

Gene NSD3, Length 1,581 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSD3-204	ENST00000525081	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	FGFR2	P21802	821 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	TNFAIP1	Q13829	316 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	WNK4	Q96J92	1243 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	HTT	P42858	3142 aa		13.72	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	EYA2	O00167	538 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	TEPSIN	Q96N21	525 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.71	□□□□□ -0.21
NSD3-204	ENST00000525081	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	GJA5	P36382	358 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CACNB3	P54284	484 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	SOX10	P56693	466 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	SIL1	Q9H173	461 aa		13.71	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	UNCX	A6NJT0	531 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	IFNL1	Q8IU54	200 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	TEKT1	Q969V4	418 aa		13.7	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CENPF	P49454	3210 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	LPIN2	Q92539	896 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	ELP3	Q9H9T3	547 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.69	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	OTOF	Q9HC10	1997 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	FKTN	O75072	461 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	ALDH1A1	P00352	501 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	SLC5A1	P13866	664 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	INHBE	P58166	350 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	TNNI2	P48788	182 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	OPTN	Q96CV9	577 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	MEIS3	Q99687	375 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	BRCA2	P51587	3418 aa		13.67	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	VGLL4	Q14135	290 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	PTPN18	Q99952	460 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	MRI	Q9BWK5	157 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CIAO1	O76071	339 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	ATP2B3	Q16720	1220 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	MAST3	O60307	1309 aa		13.66	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	LAMB1	P07942	1786 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	PRDX5	P30044	214 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	MAP3K9	P80192	1104 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	CRHR2	Q13324	411 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.65	□□□□□ -0.22
NSD3-204	ENST00000525081	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	PHKA1	P46020	1223 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.64	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ADORA1	P30542	326 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	FAM83A	Q86UY5	434 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CSAD	Q9Y600	493 aa		13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	WRNIP1	Q96S55	665 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	TRIM17	Q9Y577	477 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.62	□□□□□ -0.23
NSD3-204	ENST00000525081	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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