RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518885.1

CNOT7-204, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 7, human

TSL 3

Gene CNOT7, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT7-204	ENST00000518885	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		29.89	■■■□□ 2.38
CNOT7-204	ENST00000518885	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	CLRN2	A0PK11	232 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	TNNI2	P48788	182 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	TFCP2	Q12800	502 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	29.88	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	RLBP1	P12271	317 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	ATP8B2	P98198	1209 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	29.87	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		29.87	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885		A0A1B0GUL7	405 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	29.86	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	GORAB	Q5T7V8	394 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC102B	Q68D86	513 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		29.86	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC10A3	P09131	477 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	SSH3	Q8TE77	659 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	29.85	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		29.85	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	TIMM10	P62072	90 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	POLA2	Q14181	598 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		29.84	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	29.83	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PHKA1	P46020	1223 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	PANK1	Q8TE04	598 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	XAGE2	Q96GT9	111 aa		29.83	■■■□□ 2.37
CNOT7-204	ENST00000518885	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	RASA3	Q14644	834 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		29.82	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	UNCX	A6NJT0	531 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	ADORA1	P30542	326 aa		29.81	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	GRIK5	Q16478	980 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	SLF2	Q8IX21	1173 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	GPR108	Q9NPR9	543 aa		29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	PRKG1	Q13976	671 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	HOOK2	Q96ED9	719 aa		29.79	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	LBX1	P52954	281 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	MOB2	Q70IA6	237 aa		29.78	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	TNS4	Q8IZW8	715 aa		29.77	■■■□□ 2.36
CNOT7-204	ENST00000518885	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	RASGRF1	Q13972	1273 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	MAP3K11	Q16584	847 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	IFFO2	Q5TF58	517 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		29.76	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	29.76	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	PRDX5	P30044	214 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	CEP85	Q6P2H3	762 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	FAM83A	Q86UY5	434 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		29.75	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	AOX1	Q06278	1338 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	29.74	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	ABCF2	Q9UG63	623 aa		29.74	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	HMMR	O75330	724 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	PDE3A	Q14432	1141 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.73	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SPATA5	Q8NB90	893 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	COG6	Q9Y2V7	657 aa		29.72	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SREBF2	Q12772	1141 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	ZIC5	Q96T25	663 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		29.71	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	ERICH6	Q7L0X2	663 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	CSRNP1	Q96S65	589 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		29.7	■■■□□ 2.35
CNOT7-204	ENST00000518885	GSTO1	P78417	241 aa		29.69	■■■□□ 2.34

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