RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	SUCLG2	Q96I99	432 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NBPF4	Q96M43	638 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TNMD	Q9H2S6	317 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		5.86	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PXDN	Q92626	1479 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB7C	A1YPR0	619 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	GRM8	O00222	908 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TLL1	O43897	1013 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NEMF	O60524	1076 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	JAK2	O60674	1132 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF20A	O95235	890 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ADH1B	P00325	375 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CBX1	P83916	185 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNC4	Q03721	635 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CAMK4	Q16566	473 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF20	Q5VTR2	975 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	C14orf37	Q86TY3	774 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CKAP2L	Q8IYA6	745 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA32	Q96LK8	384 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ARID3A	Q99856	593 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LLPH	Q9BRT6	129 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	OGFR	Q9NZT2	677 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TCHH	Q07283	1943 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		5.85	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM94	Q12767	1356 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	BTBD11	A6QL63	1104 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PFKFB2	O60825	505 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	IGKV5-2	P06315	115 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	USP17L8	P0C7I0	530 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP5J	P18859	108 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF165	P49910	485 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	KRT32	Q14532	448 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	MSS51	Q4VC12	460 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NUTM2G	Q5VZR2	741 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	TICAM2	Q86XR7	235 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	BRF1	Q92994	677 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	EID1	Q9Y6B2	187 aa		5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCC6	O95255	1503 aa		5.84	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF609	O15014	1411 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CTAGE5	O15320	804 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CTDNEP1	O95476	244 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TNNT1	P13805	278 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	JUND	P17535	347 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNJ4	P48050	445 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCZ1B	P86790	482 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	TEF	Q10587	303 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SNW1	Q13573	536 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	MCM6	Q14566	821 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	STX1A	Q16623	288 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ATL3	Q6DD88	541 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	LYPD8	Q6UX82	237 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
ATXN3-212	ENST00000515746	ABTB2	Q8N961	1025 aa		5.83	□□□□□ -1.48

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