RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 EFCC1Q9HA90 598 aa22.79■■□□□ 1.24
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ITGA3-215ENST00000515147 SP3Q02447 781 aa22.78■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.78■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 OPTNQ96CV9 577 aa22.78■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
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ITGA3-215ENST00000515147 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.77■■□□□ 1.24
ITGA3-215ENST00000515147 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
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ITGA3-215ENST00000515147 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
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ITGA3-215ENST00000515147 TMEM39BQ9GZU3 492 aa22.73■■□□□ 1.23
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ITGA3-215ENST00000515147 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.72■■□□□ 1.23
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ITGA3-215ENST00000515147 MAP3K9P80192 1104 aa22.69■■□□□ 1.22
ITGA3-215ENST00000515147 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
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ITGA3-215ENST00000515147 CTGFP29279 349 aa22.6■■□□□ 1.21
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ITGA3-215ENST00000515147 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.6■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 MRIQ9BWK5 157 aa22.6■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 KIF16BQ96L93 1317 aa22.59■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
ITGA3-215ENST00000515147 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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