RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514318.1

RACK1-232, Transcript of receptor for activated C kinase 1, humanhuman

TSL 3

Gene RACK1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1-232ENST00000514318 MYH13Q9UKX3 1938 aa20.38■□□□□ 0.85
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RACK1-232ENST00000514318 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.38■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.38■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
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RACK1-232ENST00000514318 GRIK5Q16478 980 aa20.37■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.37■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.37■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 OPTNQ96CV9 577 aa20.37■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 ERO1AQ96HE7 468 aa20.37■□□□□ 0.85
RACK1-232ENST00000514318 ELP3Q9H9T3 547 aa20.37■□□□□ 0.85
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RACK1-232ENST00000514318 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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RACK1-232ENST00000514318 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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RACK1-232ENST00000514318 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.28■□□□□ 0.84
RACK1-232ENST00000514318 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.28■□□□□ 0.84
RACK1-232ENST00000514318 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RACK1-232ENST00000514318 MAST3O60307 1309 aa20.27■□□□□ 0.84
RACK1-232ENST00000514318 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.27■□□□□ 0.84
RACK1-232ENST00000514318 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.27■□□□□ 0.84
RACK1-232ENST00000514318 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.26■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
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RACK1-232ENST00000514318 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.25■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 ERO1BQ86YB8 467 aa20.25■□□□□ 0.83
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RACK1-232ENST00000514318 WRNIP1Q96S55 665 aa20.25■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 E9PSI1 815 aa20.24■□□□□ 0.83
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RACK1-232ENST00000514318 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 ZNF333Q96JL9 665 aa20.24■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 EYA2O00167 538 aa20.23■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 PPIL2Q13356 520 aa20.23■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 ARHGEF6Q15052 776 aa20.23■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa20.23■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 AK9Q5TCS8 1911 aa20.23■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 BTBD19C9JJ37 291 aa20.22■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 IRF6O14896 467 aa20.22■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 SLC5A1P13866 664 aa20.22■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 EN2P19622 333 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 DCAF15Q66K64 600 aa20.22■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 ATG9AQ7Z3C6 839 aa20.22■□□□□ 0.83
RACK1-232ENST00000514318 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.22■□□□□ 0.83
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