RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 ELP3Q9H9T3 547 aa20.58■□□□□ 0.89
ITGA3-211ENST00000508100 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
ITGA3-211ENST00000508100 CRHR2Q13324 411 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 OPTNQ96CV9 577 aa20.57■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 GJA5P36382 358 aa20.56■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 LRRC24Q50LG9 513 aa20.56■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM39BQ9GZU3 492 aa20.56■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 PDE8BO95263 885 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 TEPSINQ96N21 525 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 CSADQ9Y600 493 aa20.55■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 PTPRCP08575 1304 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 MAP3K9P80192 1104 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD44Q8N8A2 993 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 TEKT1Q969V4 418 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 PTPN18Q99952 460 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.54■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 SP3Q02447 781 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 GRIK5Q16478 980 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 EFCC1Q9HA90 598 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF521Q96K83 1311 aa20.53■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 BCAMP50895 628 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 GTF2A2P52657 109 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 VGLL4Q14135 290 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 PTPN22Q9Y2R2 807 aa20.52■□□□□ 0.88
ITGA3-211ENST00000508100 MAST3O60307 1309 aa20.52■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 LAMB1P07942 1786 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ARHGEF6Q15052 776 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 CCL15Q16663 113 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 HOOK2Q96ED9 719 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 OTUD5Q96G74 571 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 MRIQ9BWK5 157 aa20.51■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 E9PSI1 815 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 CACNB3P54284 484 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 USP44Q9H0E7 712 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa20.5■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 OTOFQ9HC10 1997 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 KIF16BQ96L93 1317 aa20.49■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 SLC5A1P13866 664 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 FAM83AQ86UY5 434 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 PCDH10Q9P2E7 1040 aa20.48■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 EYA2O00167 538 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 WRNIP1Q96S55 665 aa20.47■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 POTEFA5A3E0 1075 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 SPDYE5A6NIY4 337 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 CETPP11597 493 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 FGFR2P21802 821 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 DCAF15Q66K64 600 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 ERO1BQ86YB8 467 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 LPIN2Q92539 896 aa20.46■□□□□ 0.87
ITGA3-211ENST00000508100 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 FAM43AQ8N2R8 423 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ARMC5Q96C12 935 aa20.45■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 SLFN5Q08AF3 891 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 SNAPC2Q13487 334 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 TMEM106CQ9BVX2 250 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa20.44■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 KIF22Q14807 665 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 NBPF11Q86T75 865 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 GCC1Q96CN9 775 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF341Q9BYN7 854 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 SMC4Q9NTJ3 1288 aa20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 MIGA2Q7L4E1 593 aa20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 IRF6O14896 467 aa20.41■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 CAP1Q01518 475 aa20.41■□□□□ 0.86
ITGA3-211ENST00000508100 PPIL2Q13356 520 aa20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms