RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505552.1

ITGA3-205, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-205ENST00000505552 TGFB2P61812 414 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MPNDQ8N594 471 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 CNKSR1Q969H4 720 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DSCC1Q9BVC3 393 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ANO2Q9NQ90 1003 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 KCNQ5Q9NR82 932 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 FOCADQ5VW36 1801 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 YDJCA8MPS7 323 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 GSG1L2A8MUP6 293 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 GPAA1O43292 621 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 IGSF3O75054 1194 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DDIT3P35638 169 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MECOMQ03112 1051 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ALX1Q15699 326 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 CAVIN4Q5BKX8 364 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 TTLL5Q6EMB2 1281 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 VPS37DQ86XT2 251 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 LCORLQ8N3X6 602 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 JAG2Q9Y219 1238 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MYH2Q9UKX2 1941 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ZMYM6O95789 1325 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 SMIM22K7EJ46 135 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 NFKBIEO00221 500 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 PRKAB2O43741 272 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 C21orf2O43822 256 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 IDH1O75874 414 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 FGAP02671 866 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 SLC4A3P48751 1232 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ST3GAL1Q11201 340 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 BECN1Q14457 450 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 RABEP1Q15276 862 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 WASHC4Q2M389 1173 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ZNF804AQ7Z570 1209 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 TTLL6Q8N841 843 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 PSMD1Q99460 953 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 TM6SF1Q9BZW5 370 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 COA1Q9GZY4 146 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 GAKO14976 1311 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 LAMB1P07942 1786 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 C6orf229H3BNL8 230 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 RIMBP2O15034 1052 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MBD4O95243 580 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 CPA1P15085 419 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 RHBDL3P58872 404 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 PPP4CP60510 307 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 EVX2Q03828 476 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MAP3K12Q12852 859 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DOK7Q18PE1 504 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DACT2Q5SW24 774 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 WDR66Q8TBY9 1149 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 GMLQ99445 158 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 MXD3Q9BW11 206 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ARMT1Q9H993 441 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 SIPA1L1O43166 1804 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 ECM29Q5VYK3 1845 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-205ENST00000505552 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 FGRP09769 529 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 CYP7A1P22680 504 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 POLD1P28340 1107 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 ANTXR2P58335 489 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 AOC3Q16853 763 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 PODNQ7Z5L7 613 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 TBC1D10CQ8IV04 446 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 MIGA1Q8NAN2 632 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 AGXT2Q9BYV1 514 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-205ENST00000505552 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.77□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms