RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 BMP6P22004 513 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 ZNF165P49910 485 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 ATP11AP98196 1134 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 TNP2Q05952 138 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 SPEM2Q0P670 501 aa6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 CRBNQ96SW2 442 aa6.95□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 B2RBV5 119 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 PRR20CP86479 221 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 PRR20DP86480 221 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 PRR20AP86496 221 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 MTERF2Q49AM1 385 aa6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 PFDN2Q9UHV9 154 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.94□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 MASP1P48740 699 aa6.93□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 LBRQ14739 615 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 LAMC2Q13753 1193 aa6.92□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 TMX1Q9H3N1 280 aa6.92□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 SLC52A1Q9NWF4 448 aa6.92□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 PPP2R3AQ06190 1150 aa6.91□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.9□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 S100BP04271 92 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 PDGFRBP09619 1106 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 SIK1P57059 783 aa6.9□□□□□ -1.3
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HERC3-209ENST00000504994 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 ANTXR1Q9H6X2 564 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 EFCC1Q9HA90 598 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.9□□□□□ -1.3
HERC3-209ENST00000504994 A0A1W2PQH9 124 aa6.89□□□□□ -1.31
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