RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504270.2

CD27-AS1-204, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CD27-AS1, Length 700 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-204ENST00000504270 IL15P40933 162 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP85Q6P2H3 762 aa13.58□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 COPRSQ9NQ92 184 aa13.58□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP126Q9P2H0 1117 aa13.58□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CEP290O15078 2479 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 WNT10BO00744 389 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CIAO1O76071 339 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IFNL1Q8IU54 200 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 FBXO3Q9UK99 471 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 FZD1Q9UP38 647 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PTPN22Q9Y2R2 807 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.57□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SNAP23O00161 211 aa13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 POLA2Q14181 598 aa13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PODNQ7Z5L7 613 aa13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 OGFOD1Q8N543 542 aa13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SSH3Q8TE77 659 aa13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERO1AQ96HE7 468 aa13.56□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PDE8BO95263 885 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 UBE4AQ14139 1066 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATG9AQ7Z3C6 839 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 VPS37DQ86XT2 251 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ARMC5Q96C12 935 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC10A4Q96EP9 437 aa13.55□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 OTOFQ9HC10 1997 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 DACT2Q5SW24 774 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF804AQ7Z570 1209 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 WNK4Q96J92 1243 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 TMEM106CQ9BVX2 250 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 EFCC1Q9HA90 598 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 BRCA2P51587 3418 aa13.54□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 APBB1O00213 710 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC5A1P13866 664 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 KLRK1P26718 216 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 INHBEP58166 350 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 TFCP2Q12800 502 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CRHR2Q13324 411 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CAVIN4Q5BKX8 364 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 EXOC6Q8TAG9 804 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 CLMNQ96JQ2 1002 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 COA1Q9GZY4 146 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 BCL11AQ9H165 835 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 AKAP2Q9Y2D5 859 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYO3BQ8WXR4 1341 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 MED23Q9ULK4 1368 aa13.53□□□□□ -0.24
CD27-AS1-204ENST00000504270 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 ATP2B3Q16720 1220 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 VGLL2Q8N8G2 317 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 LPIN2Q92539 896 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 NEUROD6Q96NK8 337 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SSC5DA1L4H1 1573 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa13.52□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 A0A1B0GUL6 1792 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 H0YGN5 161 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 MYCP01106 439 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 GYG1P46976 350 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CAP1Q01518 475 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 AAMPQ13685 434 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 GORABQ5T7V8 394 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 STRIP1Q5VSL9 837 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SZT2Q5T011 3432 aa13.51□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SP3Q02447 781 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 ZNF333Q96JL9 665 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 DEFB129Q9H1M3 183 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CD209Q9NNX6 404 aa13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 DLL1O00548 723 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 FGFR2P21802 821 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 BCAMP50895 628 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 TIMM10P62072 90 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CD27-AS1-204ENST00000504270 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms