RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF417Q8TAU3 575 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 C8orf37Q96NL8 207 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 MDFIQ99750 246 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 ADAM19Q9H013 955 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 SOX13Q9UN79 622 aa6.79□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 EPHA1P21709 976 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 ERMP1Q7Z2K6 904 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 TTC9Q92623 222 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM74Q96NL1 305 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 CBX8Q9HC52 389 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 SAMM50Q9Y512 469 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 PPME1Q9Y570 386 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-215ENST00000498054 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 LINC01387J3KSC0 135 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ENC1O14682 589 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PAGE1O75459 146 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ARL4DP49703 201 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 LIG3P49916 1009 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 GSTM4Q03013 218 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CD163Q86VB7 1156 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 TLR6Q9Y2C9 796 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 H3BRJ5 948 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 FURINP09958 794 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CHRNA4P43681 627 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 FAM160A1Q05DH4 1040 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PCNX4Q63HM2 1172 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SPON2Q9BUD6 331 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 IGSF3O75054 1194 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 B3GALT4O96024 378 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PAK2Q13177 524 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SNAP47Q5SQN1 464 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 VPS37DQ86XT2 251 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SULF2Q8IWU5 870 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PHC3Q8NDX5 983 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM11Q96F44 468 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CARD10Q9BWT7 1032 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PF4P02776 101 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 NME2P22392 152 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ARNTP27540 789 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 GRIK5Q16478 980 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 HGSNATQ68CP4 663 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 MSL1Q68DK7 614 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 DRC1Q96MC2 740 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PLVAPQ9BX97 442 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 FSCN2O14926 492 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PIP4K2BP78356 416 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 C19orf57Q0VDD7 668 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 LRRC14Q15048 493 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 GOLM1Q8NBJ4 401 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 KCNB2Q92953 911 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 TINF2Q9BSI4 451 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 TANGO6Q9C0B7 1094 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 BMP6P22004 513 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 ARID5AQ03989 594 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 AGMOQ6ZNB7 445 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 STK35Q8TDR2 534 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 GPRASP2Q96D09 838 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CYP8B1Q9UNU6 501 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-215ENST00000498054 CYP11A1P05108 521 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-215ENST00000498054 RPS26P62854 115 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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