RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.54■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 RNF186Q9NXI6 227 aa21.54■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 FZD1Q9UP38 647 aa21.54■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 TRPA1O75762 1119 aa21.53■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 TNFAIP1Q13829 316 aa21.53■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 RASA3Q14644 834 aa21.53■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.53■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.53■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 COPRSQ9NQ92 184 aa21.53■■□□□ 1.04
APTX-232ENST00000495360 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
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APTX-232ENST00000495360 TEKT1Q969V4 418 aa21.52■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 MAST3O60307 1309 aa21.51■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 SRGAP3O43295 1099 aa21.51■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.51■■□□□ 1.03
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APTX-232ENST00000495360 MAP3K11Q16584 847 aa21.5■■□□□ 1.03
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APTX-232ENST00000495360 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.49■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 MTX1Q13505 466 aa21.49■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 GNAI2P04899 355 aa21.48■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 TNNI2P48788 182 aa21.48■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 ZDHHC15Q96MV8 337 aa21.48■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 MYH13Q9UKX3 1938 aa21.47■■□□□ 1.03
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APTX-232ENST00000495360 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.47■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.47■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.47■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 MRIQ9BWK5 157 aa21.47■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.47■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.46■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 PHKA1P46020 1223 aa21.46■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 SREBF2Q12772 1141 aa21.46■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 TEPSINQ96N21 525 aa21.46■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.46■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.46■■□□□ 1.03
APTX-232ENST00000495360 UNCXA6NJT0 531 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 ADORA1P30542 326 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 TM4SF4P48230 202 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 CACNB3P54284 484 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 DGKZQ13574 1117 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 MCOLN1Q9GZU1 580 aa21.45■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 SEMA3EO15041 775 aa21.44■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
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APTX-232ENST00000495360 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
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APTX-232ENST00000495360 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.43■■□□□ 1.02
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APTX-232ENST00000495360 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa21.42■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 A0A1B0GUL7 405 aa21.42■■□□□ 1.02
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APTX-232ENST00000495360 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.42■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.41■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.41■■□□□ 1.02
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APTX-232ENST00000495360 FAM83AQ86UY5 434 aa21.4■■□□□ 1.02
APTX-232ENST00000495360 XAGE2Q96GT9 111 aa21.4■■□□□ 1.02
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APTX-232ENST00000495360 ZBTB22O15209 634 aa21.39■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.39■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 RASGRF1Q13972 1273 aa21.39■■□□□ 1.01
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APTX-232ENST00000495360 ELP3Q9H9T3 547 aa21.39■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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APTX-232ENST00000495360 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 ALDH1A1P00352 501 aa21.37■■□□□ 1.01
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APTX-232ENST00000495360 GJA5P36382 358 aa21.37■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 IFNL1Q8IU54 200 aa21.37■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 OPTNQ96CV9 577 aa21.37■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 HOOK2Q96ED9 719 aa21.37■■□□□ 1.01
APTX-232ENST00000495360 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.37■■□□□ 1.01
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