RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495022.5

TRDMT1-211, Transcript of tRNA aspartic acid methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRDMT1, Length 1,374 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDMT1-211ENST00000495022 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa28.33■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 USP44Q9H0E7 712 aa28.33■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa28.33■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TRDMT1-211ENST00000495022 CRKP46108 304 aa28.32■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 SLFN5Q08AF3 891 aa28.32■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ALDH1L2Q3SY69 923 aa28.31■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP28.31■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 KIF16BQ96L93 1317 aa28.3■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TNNI2P48788 182 aa28.29■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TEPSINQ96N21 525 aa28.29■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CENPFP49454 3210 aa28.29■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP28.28■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 KLHDC4Q8TBB5 520 aa28.28■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 GJA5P36382 358 aa28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 GRIK5Q16478 980 aa28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa28.27■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TCP10L2B9ZVM9 353 aa28.26■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 TEKT1Q969V4 418 aa28.26■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 MRIQ9BWK5 157 aa28.26■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa28.26■■■□□ 2.12
TRDMT1-211ENST00000495022 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 FGFR2P21802 821 aa28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 BCAMP50895 628 aa28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TMEM39BQ9GZU3 492 aa28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 MAST3O60307 1309 aa28.25■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SMC4Q9NTJ3 1288 aa28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 CDAN1Q8IWY9 1227 aa28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 ZDHHC15Q96MV8 337 aa28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 ELP3Q9H9T3 547 aa28.24■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 AK9Q5TCS8 1911 aa28.23■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 EYA2O00167 538 aa28.23■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 OPTNQ96CV9 577 aa28.23■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 CDCA7LQ96GN5 454 aa28.22■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC5A1P13866 664 aa28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 FKBP1CQ5VVH2 108 aa28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 LPIN2Q92539 896 aa28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN18Q99952 460 aa28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 TMOD2Q9NZR1 351 aa28.21■■■□□ 2.11
TRDMT1-211ENST00000495022 SLC34A2O95436 690 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 MAP3K9P80192 1104 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 CRHR2Q13324 411 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 VGLL4Q14135 290 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 FAM83AQ86UY5 434 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 ERO1AQ96HE7 468 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 MS4A4AQ96JQ5 239 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 FBXO3Q9UK99 471 aa28.2■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 HHIPL2Q6UWX4 724 aa28.19■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 OTOP1Q7RTM1 612 aa28.19■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 TRIM17Q9Y577 477 aa28.19■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 CSADQ9Y600 493 aa28.19■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 WDR66Q8TBY9 1149 aa28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP28.18■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 CACNB3P54284 484 aa28.17■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 HOOK2Q96ED9 719 aa28.17■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 CIAO1O76071 339 aa28.16■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 GTF2A2P52657 109 aa28.16■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 MYH2Q9UKX2 1941 aa28.15■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 BRI3BPQ8WY22 251 aa28.14■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 HDAC5Q9UQL6 1122 aa28.14■■■□□ 2.1
TRDMT1-211ENST00000495022 BRCA2P51587 3418 aa28.14■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SPDYE5A6NIY4 337 aa28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SP3Q02447 781 aa28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 CCL15Q16663 113 aa28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 CD99L2Q8TCZ2 262 aa28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 OTUD5Q96G74 571 aa28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SIL1Q9H173 461 aa28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 CEP126Q9P2H0 1117 aa28.12■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 ATP2B3Q16720 1220 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 DCAF15Q66K64 600 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 WRNIP1Q96S55 665 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 PTPN22Q9Y2R2 807 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 ERO1BQ86YB8 467 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 EFCC1Q9HA90 598 aa28.11■■■□□ 2.09
TRDMT1-211ENST00000495022 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms