RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TRPA1O75762 1119 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GNAI2P04899 355 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPDYE2Q495Y8 402 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RNF186Q9NXI6 227 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FZD1Q9UP38 647 aa23.98■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNFAIP1Q13829 316 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TEKT1Q969V4 418 aa23.97■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LDLRAD1Q5T700 205 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM57Q8N5G2 664 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WDR66Q8TBY9 1149 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.96■■□□□ 1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MTX1Q13505 466 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MRIQ9BWK5 157 aa23.95■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAST3O60307 1309 aa23.94■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNNI2P48788 182 aa23.93■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PHKA1P46020 1223 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TIMM10P62072 90 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TFCP2Q12800 502 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP3K11Q16584 847 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.92■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ADORA1P30542 326 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMOD2Q9NZR1 351 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.91■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CACNB3P54284 484 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPRYD7Q5W111 196 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC102BQ68D86 513 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HHIPL2Q6UWX4 724 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.9■■□□□ 1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SEMA3EO15041 775 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TM4SF4P48230 202 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABHD8Q96I13 439 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CLMNQ96JQ2 1002 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SSC5DA1L4H1 1573 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ARAP2Q8WZ64 1704 aa23.89■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A1B0GUL7 405 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UNCXA6NJT0 531 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SREBF2Q12772 1141 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ITPRIPQ8IWB1 547 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TEPSINQ96N21 525 aa23.88■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDAN1Q8IWY9 1227 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 XAGE2Q96GT9 111 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.87■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRDX5P30044 214 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DGKZQ13574 1117 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AKAP11Q9UKA4 1901 aa23.86■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TBC1D8O95759 1140 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DIXDC1Q155Q3 683 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GORABQ5T7V8 394 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 WNK4Q96J92 1243 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MCOLN1Q9GZU1 580 aa23.85■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SALL1Q9NSC2 1324 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RLBP1P12271 317 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ATP8B2P98198 1209 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FKBP1CQ5VVH2 108 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 FAM83AQ86UY5 434 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INHBEP58166 350 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RASGRF1Q13972 1273 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ABCF2Q9UG63 623 aa23.83■■□□□ 1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ZBTB22O15209 634 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MAP3K9P80192 1104 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ELP3Q9H9T3 547 aa23.82■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CCDC85CA6NKD9 419 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 POLA2Q14181 598 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HOOK2Q96ED9 719 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 USP40Q9NVE5 1235 aa23.81■■□□□ 1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms