RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492728.1

CHD1L-209, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 1 like, humanhuman

TSL 2

Gene CHD1L, Length 662 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1L-209ENST00000492728 TBC1D8O95759 1140 aa23.08■■□□□ 1.29
CHD1L-209ENST00000492728 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CHD1L-209ENST00000492728 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CHD1L-209ENST00000492728 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa23.07■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 LAMB1P07942 1786 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 GJA5P36382 358 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 CACNB3P54284 484 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 LPIN2Q92539 896 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 WNK4Q96J92 1243 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM39BQ9GZU3 492 aa23.06■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 CIAO1O76071 339 aa23.05■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 SLC5A1P13866 664 aa23.05■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa23.05■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 BCAR3O75815 825 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 SREBF2Q12772 1141 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 TNFAIP1Q13829 316 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 TEKT1Q969V4 418 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 SLC10A4Q96EP9 437 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.03■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 TRIM27P14373 513 aa23.02■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 ATP2B3Q16720 1220 aa23.02■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.02■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 FBXO3Q9UK99 471 aa23.02■■□□□ 1.28
CHD1L-209ENST00000492728 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 IREB2P48200 963 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 MIER1Q8N108 512 aa23.01■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 COPRSQ9NQ92 184 aa23.01■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 GPR25O00155 361 aa23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 ADORA1P30542 326 aa23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 PHKA1P46020 1223 aa23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 CFHR5Q9BXR6 569 aa23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 CEP126Q9P2H0 1117 aa23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 PRDX5P30044 214 aa22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 IFNL1Q8IU54 200 aa22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 MRIQ9BWK5 157 aa22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 ELP3Q9H9T3 547 aa22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa22.99■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 UNCXA6NJT0 531 aa22.98■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 RGS19P49795 217 aa22.98■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 DIXDC1Q155Q3 683 aa22.98■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 MAST3O60307 1309 aa22.98■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 MTX1Q13505 466 aa22.97■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.97■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.97■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.97■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 TNNI2P48788 182 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 VGLL4Q14135 290 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 OPTNQ96CV9 577 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 PTPN18Q99952 460 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa22.96■■□□□ 1.27
CHD1L-209ENST00000492728 SRGAP3O43295 1099 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 GNAI3P08754 354 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 HTTP42858 3142 aa22.95■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 CCDC102BQ68D86 513 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.94■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 INHBEP58166 350 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 TIMM10P62072 90 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 TFCP2Q12800 502 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 NFIAQ12857 509 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 FKBP1CQ5VVH2 108 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 FAM83AQ86UY5 434 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.93■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 FKTNO75072 461 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 ALDH1A1P00352 501 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 SOX10P56693 466 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 MAP3K9P80192 1104 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 RASGRF1Q13972 1273 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.92■■□□□ 1.26
CHD1L-209ENST00000492728 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.92■■□□□ 1.26
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