RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492601.2

SGMS1-204, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 625 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-204ENST00000492601 SLC5A1P13866 664 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 TM4SF4P48230 202 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 SPRYD7Q5W111 196 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.55■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 TNFAIP1Q13829 316 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 MAP3K11Q16584 847 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 MEIS3Q99687 375 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 KIF16BQ96L93 1317 aa21.54■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 SREBF2Q12772 1141 aa21.53■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 LPIN2Q92539 896 aa21.53■■□□□ 1.04
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SGMS1-204ENST00000492601 TEKT1Q969V4 418 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.52■■□□□ 1.04
SGMS1-204ENST00000492601 CIAO1O76071 339 aa21.51■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 CEP126Q9P2H0 1117 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.51■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 CACNB3P54284 484 aa21.5■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 FBXO3Q9UK99 471 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 TNNI2P48788 182 aa21.49■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 BCAR3O75815 825 aa21.48■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 IL15P40933 162 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 MAST3O60307 1309 aa21.48■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 GPR25O00155 361 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 ELP3Q9H9T3 547 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 COPRSQ9NQ92 184 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-204ENST00000492601 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 GNAI3P08754 354 aa21.46■■□□□ 1.03
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SGMS1-204ENST00000492601 ADORA1P30542 326 aa21.45■■□□□ 1.02
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SGMS1-204ENST00000492601 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.45■■□□□ 1.02
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SGMS1-204ENST00000492601 TIMM10P62072 90 aa21.42■■□□□ 1.02
SGMS1-204ENST00000492601 MAP3K9P80192 1104 aa21.42■■□□□ 1.02
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SGMS1-204ENST00000492601 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.42■■□□□ 1.02
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SGMS1-204ENST00000492601 MTX1Q13505 466 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-204ENST00000492601 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-204ENST00000492601 CSADQ9Y600 493 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-204ENST00000492601 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa21.4■■□□□ 1.02
SGMS1-204ENST00000492601 SEMA3EO15041 775 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-204ENST00000492601 SOX10P56693 466 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-204ENST00000492601 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-204ENST00000492601 PTPN18Q99952 460 aa21.39■■□□□ 1.01
SGMS1-204ENST00000492601 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
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