RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492545.1

CTDSP1-211, Transcript of CTD small phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDSP1, Length 634 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1-211ENST00000492545 SPDYE2Q495Y8 402 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 RASAL3Q86YV0 1011 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM57Q8N5G2 664 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 VEZTQ9HBM0 779 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 UNCXA6NJT0 531 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 SEMA3EO15041 775 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 MOB2Q70IA6 237 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 TEKT1Q969V4 418 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 SAGE1Q9NXZ1 904 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 TNNQ9UQP3 1299 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 AKAP2Q9Y2D5 859 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 RASA3Q14644 834 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 LDLRAD1Q5T700 205 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 MAP3K11Q16584 847 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 CSRNP1Q96S65 589 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 TNNI2P48788 182 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 GRIK5Q16478 980 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 HHIPL2Q6UWX4 724 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 DENND2AQ9ULE3 1009 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP29.33■■■□□ 2.29
CTDSP1-211ENST00000492545 AOX1Q06278 1338 aa29.32■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 ECM29Q5VYK3 1845 aa29.31■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 ARAP2Q8WZ64 1704 aa29.31■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 PRKG1Q13976 671 aa29.3■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 SALL1Q9NSC2 1324 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 TIMM10P62072 90 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 FKBP1CQ5VVH2 108 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 CCDC102BQ68D86 513 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 RNF186Q9NXI6 227 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 TMOD2Q9NZR1 351 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 TSKSQ9UJT2 592 aa29.29■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 A0A1B0GUL7 405 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 MS4A1P11836 297 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 PHKA1P46020 1223 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 IREB2P48200 963 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 TFCP2Q12800 502 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 MVPQ14764 893 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 SLC10A4Q96EP9 437 aa29.28■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa29.27■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.27■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 ITPRIPQ8IWB1 547 aa29.27■■■□□ 2.28
CTDSP1-211ENST00000492545 LDHBP07195 334 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 TM4SF4P48230 202 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 ATP8B2P98198 1209 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM83AQ86UY5 434 aa29.26■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 TCP10L2B9ZVM9 353 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 TRPA1O75762 1119 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 ADORA1P30542 326 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SREBF2Q12772 1141 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 POLA2Q14181 598 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 XAGE2Q96GT9 111 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 TEPSINQ96N21 525 aa29.25■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 USP2O75604 605 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 RLBP1P12271 317 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SPRYD7Q5W111 196 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SSH3Q8TE77 659 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 HOOK2Q96ED9 719 aa29.24■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SSC5DA1L4H1 1573 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 INHBEP58166 350 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa29.23■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 NEUROD6Q96NK8 337 aa29.22■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 PRDX5P30044 214 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 RASGRF1Q13972 1273 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 TMEM39BQ9GZU3 492 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 FZD1Q9UP38 647 aa29.21■■■□□ 2.27
CTDSP1-211ENST00000492545 GORABQ5T7V8 394 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SLF2Q8IX21 1173 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 GPR108Q9NPR9 543 aa29.2■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa29.19■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 AKAP11Q9UKA4 1901 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CLMNQ96JQ2 1002 aa29.18■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP29.18■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 SURF6O75683 361 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 ALDH1A1P00352 501 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CACNB3P54284 484 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 DIXDC1Q155Q3 683 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 WNK4Q96J92 1243 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 MYH13Q9UKX3 1938 aa29.17■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CAPN15O75808 1086 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.16■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
CTDSP1-211ENST00000492545 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa29.15■■■□□ 2.26
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