RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491053.5

USP20-206, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 590 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-206ENST00000491053 LDHBP07195 334 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 CRKP46108 304 aa20.18■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 TEKT1Q969V4 418 aa20.18■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.18■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 APBB1O00213 710 aa20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 MCAMP43121 646 aa20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 GRIK5Q16478 980 aa20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 HHIPL2Q6UWX4 724 aa20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 CREBZFQ9NS37 354 aa20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 MAST2Q6P0Q8 1798 aa20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 IGSF3O75054 1194 aa20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 PRDX5P30044 214 aa20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 USP48Q86UV5 1035 aa20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 CEP350Q5VT06 3117 aa20.15■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 TRAF5O00463 557 aa20.15■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 EXOC6Q8TAG9 804 aa20.15■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 ZDHHC15Q96MV8 337 aa20.15■□□□□ 0.82
USP20-206ENST00000491053 DOCK2Q92608 1830 aa20.14■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 ERICH6Q7L0X2 663 aa20.14■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 SLF2Q8IX21 1173 aa20.14■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 ABCF2Q9UG63 623 aa20.14■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 ADM5C9JUS6 153 aa20.13■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 SPDYE2Q495Y8 402 aa20.13■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 PI16Q6UXB8 463 aa20.13■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP20.13■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa20.13■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 TNFAIP1Q13829 316 aa20.12■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 GCC1Q96CN9 775 aa20.12■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa20.12■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 CST9Q5W186 159 aa20.11■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 GAKO14976 1311 aa20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 GSTO1P78417 241 aa20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 CDCA5Q96FF9 252 aa20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 SNRKQ9NRH2 765 aa20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa20.1■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 CLRN2A0PK11 232 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 ZAP70P43403 619 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 DIXDC1Q155Q3 683 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 FKBP1CQ5VVH2 108 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 DEFB129Q9H1M3 183 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 VEZTQ9HBM0 779 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 TMOD2Q9NZR1 351 aa20.09■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 AOX1Q06278 1338 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 MYH7P12883 1935 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 LDHCP07864 332 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 MECOMQ03112 1051 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 RAI14Q9P0K7 980 aa20.08■□□□□ 0.81
USP20-206ENST00000491053 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 ATP5JP18859 108 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 NF2P35240 595 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 TNNI2P48788 182 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 FKBP1BP68106 108 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 HTRA3P83110 453 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 GPATCH3Q96I76 525 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 AK9Q5TCS8 1911 aa20.07■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 RASSF10A6NK89 507 aa20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 DLK2Q6UY11 383 aa20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 BCL11AQ9H165 835 aa20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 CNTNAP1P78357 1384 aa20.06■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 FAM83AQ86UY5 434 aa20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 ZNF384Q8TF68 577 aa20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 ECHDC1Q9NTX5 307 aa20.05■□□□□ 0.8
USP20-206ENST00000491053 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms