RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 RASA3Q14644 834 aa36.32■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 ABHD8Q96I13 439 aa36.32■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 CEP126Q9P2H0 1117 aa36.32■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 SSC5DA1L4H1 1573 aa36.32■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 TRIM27P14373 513 aa36.31■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 TNFAIP1Q13829 316 aa36.31■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 MAP3K11Q16584 847 aa36.31■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP36.31■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP36.3■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa36.3■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 COPRSQ9NQ92 184 aa36.3■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 IL15P40933 162 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP36.29■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 ATP2B3Q16720 1220 aa36.28■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa36.28■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 TEKT1Q969V4 418 aa36.27■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 MRIQ9BWK5 157 aa36.27■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 TM4SF4P48230 202 aa36.26■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 TNNQ9UQP3 1299 aa36.26■■■■□ 3.4
MTMR1-211ENST00000490316 MYH13Q9UKX3 1938 aa36.26■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 WDR66Q8TBY9 1149 aa36.25■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 SLC10A4Q96EP9 437 aa36.25■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 MAST3O60307 1309 aa36.25■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 UNCXA6NJT0 531 aa36.24■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 SPRYD7Q5W111 196 aa36.24■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 CLUAP1Q96AJ1 413 aa36.24■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 TCP10L2B9ZVM9 353 aa36.23■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 SRGAP3O43295 1099 aa36.23■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 TNNI2P48788 182 aa36.23■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 MTX1Q13505 466 aa36.23■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 MCOLN1Q9GZU1 580 aa36.23■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 USP2O75604 605 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 IREB2P48200 963 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 SREBF2Q12772 1141 aa36.22■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 ZDHHC15Q96MV8 337 aa36.22■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 DGKZQ13574 1117 aa36.21■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 CLMNQ96JQ2 1002 aa36.21■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 TEPSINQ96N21 525 aa36.21■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa36.2■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
MTMR1-211ENST00000490316 GNAI2P04899 355 aa36.19■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 HHIPL2Q6UWX4 724 aa36.19■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM39BQ9GZU3 492 aa36.19■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa36.17■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 SEMA3EO15041 775 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 TBC1D8O95759 1140 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 PHKA1P46020 1223 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 CDAN1Q8IWY9 1227 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 WNK4Q96J92 1243 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 TMOD2Q9NZR1 351 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 DENND2AQ9ULE3 1009 aa36.16■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 CACNB3P54284 484 aa36.15■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 INHBEP58166 350 aa36.15■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 TMEM57Q8N5G2 664 aa36.15■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP36.14■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 ADORA1P30542 326 aa36.14■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 TIMM10P62072 90 aa36.14■■■■□ 3.38
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC85CA6NKD9 419 aa36.13■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 ZBTB22O15209 634 aa36.13■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 FKBP1CQ5VVH2 108 aa36.13■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC102BQ68D86 513 aa36.13■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 AKAP2Q9Y2D5 859 aa36.13■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 SALL1Q9NSC2 1324 aa36.12■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 PRDX5P30044 214 aa36.12■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 TFCP2Q12800 502 aa36.12■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 FAM83AQ86UY5 434 aa36.12■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 LDHBP07195 334 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 ZBED9Q6R2W3 1325 aa36.1■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 LAMB1P07942 1786 aa36.1■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 OTOFQ9HC10 1997 aa36.1■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 A0A1B0GUL7 405 aa36.1■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 CFHR5Q9BXR6 569 aa36.1■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa36.09■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 ALDH1A1P00352 501 aa36.09■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 DIXDC1Q155Q3 683 aa36.08■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP36.08■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP36.08■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa36.08■■■■□ 3.37
MTMR1-211ENST00000490316 GJA5P36382 358 aa36.07■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 IFNL1Q8IU54 200 aa36.07■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 XAGE2Q96GT9 111 aa36.07■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 ELP3Q9H9T3 547 aa36.07■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 GPR25O00155 361 aa36.06■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 MAP3K9P80192 1104 aa36.06■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP36.06■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 RASGRF1Q13972 1273 aa36.05■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 MVPQ14764 893 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP36.05■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
MTMR1-211ENST00000490316 OPTNQ96CV9 577 aa36.05■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms