RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489356.1

FGD2-208, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene FGD2, Length 1,438 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD2-208ENST00000489356 RASA3Q14644 834 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 RNF186Q9NXI6 227 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa21.93■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 TCP10L2B9ZVM9 353 aa21.92■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 SPDYE2Q495Y8 402 aa21.92■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
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FGD2-208ENST00000489356 TMEM57Q8N5G2 664 aa21.9■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.9■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
FGD2-208ENST00000489356 WDR66Q8TBY9 1149 aa21.89■■□□□ 1.1
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FGD2-208ENST00000489356 TNNI2P48788 182 aa21.88■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 CACNB3P54284 484 aa21.88■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 TIMM10P62072 90 aa21.88■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 CLMNQ96JQ2 1002 aa21.87■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.87■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa21.87■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 TMEM39BQ9GZU3 492 aa21.86■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa21.86■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 USP2O75604 605 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 DGKZQ13574 1117 aa21.85■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.85■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.85■■□□□ 1.09
FGD2-208ENST00000489356 SSC5DA1L4H1 1573 aa21.85■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 MAP3K11Q16584 847 aa21.84■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.84■■□□□ 1.09
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FGD2-208ENST00000489356 TM4SF4P48230 202 aa21.82■■□□□ 1.08
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FGD2-208ENST00000489356 C1orf115Q9H7X2 142 aa21.82■■□□□ 1.08
FGD2-208ENST00000489356 CCDC85CA6NKD9 419 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD2-208ENST00000489356 SEMA3EO15041 775 aa21.81■■□□□ 1.08
FGD2-208ENST00000489356 GORABQ5T7V8 394 aa21.81■■□□□ 1.08
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FGD2-208ENST00000489356 RLBP1P12271 317 aa21.8■■□□□ 1.08
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FGD2-208ENST00000489356 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.8■■□□□ 1.08
FGD2-208ENST00000489356 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
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FGD2-208ENST00000489356 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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FGD2-208ENST00000489356 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
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FGD2-208ENST00000489356 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.77■■□□□ 1.07
FGD2-208ENST00000489356 INHBEP58166 350 aa21.76■■□□□ 1.07
FGD2-208ENST00000489356 FKBP1CQ5VVH2 108 aa21.76■■□□□ 1.07
FGD2-208ENST00000489356 PANK1Q8TE04 598 aa21.76■■□□□ 1.07
FGD2-208ENST00000489356 OPTNQ96CV9 577 aa21.76■■□□□ 1.07
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